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印度孙德尔本斯红树林新型抗生素产生菌——洛锡安链霉菌(Streptomyces lothianensis)的发现与鉴定
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月27日 来源:Journal of Basic Microbiology 2.7
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来自印度西孟加拉邦的研究人员从孙德尔本斯洛锡安岛红树林土壤中分离出KLOTTS4A1T菌株,通过16S rRNA基因分析、基因组测序(GC含量71.03 mol%)和化学分类学研究发现其与近缘种ANI值(84.43%-87.59%)和dDDH值(29.40%)均低于物种界定阈值,细胞壁含LL-DAP型肽聚糖及特征性脂肪酸(iso-C15:0/anteiso-C15:0),最终确立为新种洛锡安链霉菌(Streptomyces lothianensis sp. nov.),为微生物资源开发提供新候选。
在印度孙德尔本斯红树林生态系统的洛锡安岛土壤沉积物中,科研人员成功分离出一株编号为KLOTTS4A1T的放线菌。通过经典的化学分类学特征分析,该菌株被确认为链霉菌属(Streptomyces)成员。令人振奋的是,16S rRNA基因比对显示其与近缘物种存在显著差异:与印度链霉菌(Streptomyces indicus)IH32-1T相似度仅97.65%,与其它近缘种的相似度也均低于98%临界值。
全基因组测序揭示该菌株GC含量为71.03 mol%。通过先进的基因组学分析手段,包括平均核苷酸一致性(ANI)和数字DNA-DNA杂交(dDDH),发现其与最近缘种的遗传距离远超新种界定标准——ANIb值84.43%、OrthoANI值84.57%,特别是dDDH值仅29.40%,远低于70%的物种划分阈值。
该菌株的细胞壁化学组成颇具特色:肽聚糖中含有LL-二氨基庚二酸(LL-DAP),主要糖组分包括核糖、甘露糖和阿拉伯糖。其极性磷脂图谱显示典型放线菌特征,含磷脂酰乙醇胺(PE)、二磷脂酰甘油(DPG)和磷脂酰肌醇(PI)。气相色谱分析则检测到iso-C15:0、anteiso-C15:0和iso-C16:0等特征性支链脂肪酸。
基于多相分类学研究,科研人员正式提出将该菌株命名为洛锡安链霉菌(Streptomyces lothianensis sp. nov.),其模式菌株KLOTTS4A1T已保藏于MTCC(13769T)、NRRL(B-65739T)和COL(B-01923T)等国际菌种保藏中心。这项发现不仅丰富了链霉菌属的物种多样性,更为新型抗生素开发提供了宝贵的微生物资源。
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