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基于棉子糖辅助的一锅式LAMP-CRISPR/Cas12b微流控技术实现植物病毒六样本并行检测
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月25日 来源:Journal of Advanced Research 13
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为解决植物病毒现场快速检测难题,研究人员开发了ALERT平台,整合RT-LAMP与CRISPR/Cas12b技术,通过棉子糖实现一锅式反应相分离,结合微流控芯片实现六样本并行检测。该平台灵敏度与RT-PCR相当,现场检测准确率达100%,为资源有限地区提供便携高效的病毒诊断工具。
植物病毒病害每年造成全球农作物产量损失高达数百亿美元,但传统检测方法如RT-PCR依赖实验室设备,难以在田间实施。尽管等温扩增技术(LAMP)简化了操作,但假阳性率高;CRISPR/Cas系统虽能精准识别病毒核酸,但多步骤操作易导致污染。如何实现高灵敏度、便携式且可并行的现场检测,成为植物病毒防控的卡脖子问题。
这项发表于《Journal of Advanced Research》的研究,由中国甘肃农业大学团队开发了ALERT平台(AapCas12b coupled RT-LAMP Extraction-field RNA testing)。关键技术包括:1) 基于3D打印的微流控芯片设计,集成特斯拉阀防止逆流;2) 棉子糖辅助的一锅式LAMP-CRISPR/Cas12b反应体系,通过密度差异实现动态扩散;3) 便携式恒温器(57±3°C)与硅胶膜核酸快速提取法;4) 使用24份田间辣椒样本验证性能。
结果部分
平台设计:微流控芯片直径60mm,含6个反应腔室,通过8°倾斜通道促进液体流动。便携孵化器采用Type-C供电,功率15W,温度波动±3°C。
优化验证:5%棉子糖使LAMP产物扩散效率提升3倍(对比蔗糖),在57°C下荧光信号最强。体积比2:1(LAMP:CRISPR)时灵敏度达100 fg/μL,与RT-PCR相当。
田间检测:对甘肃6地区24份样本检测显示,BWYV检出率25%(6/24),与qRT-PCR结果一致。硅胶膜核酸提取法较传统方法信号强度提高40%。
讨论与意义
该研究突破性地解决了LAMP与CRISPR系统兼容性问题:棉子糖通过氢键网络促进扩增产物向CRISPR区扩散,而3D打印芯片的PEG涂层(2%)增强了生物相容性。相比已有技术,ALERT将检测成本控制在12.06美元/样本,时间缩短至1小时,尤其适合发展中国家农业现场应用。
局限性在于Cas12b耐热性不足限制反应温度提升,未来可通过酶工程改造优化。研究者建议将芯片-加热器集成封闭式设计以抵御风沙干扰,这一创新为植物检疫和疫情早期预警提供了颠覆性工具。
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