综述:Cas13介导的液体活检在癌症诊断应用中的全面综述

【字体: 时间:2025年08月23日 来源:TrAC Trends in Analytical Chemistry 11.8

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  这篇综述系统阐述了CRISPR-Cas13(规律间隔成簇短回文重复序列-相关蛋白13)技术在肿瘤液体活检中的革新应用,涵盖ctDNA(循环肿瘤DNA)、CTC(循环肿瘤细胞)及EV(细胞外囊泡)等标志物的检测,通过crRNA(向导RNA)设计、纳米材料整合与微流控芯片等技术优化,实现了高灵敏度、低成本(0.5–5美元/检测)的快速诊断(10–60分钟),为癌症早期筛查和动态监测提供了突破性工具。

  

Cas13介导的液体活检:癌症诊断的技术革命

Abstract

过去十年间,基于CRISPR的分子编辑技术已广泛应用于疾病诊断领域。其中,CRISPR-Cas13作为家族重要成员,通过分析血液、尿液等生物体液中的ctDNA、CTC、miRNA(微RNA)及EV,成为肿瘤液体活检的关键工具。本文综述了不同Cas13亚型的结构特征、反应系统优化策略(如crRNA设计、纳米材料整合),并探讨了其在体内外肿瘤检测中的创新潜力。

Introduction

癌症作为全球第二大死因,其早期诊断至关重要。液体活检凭借微创、低成本等优势,可动态监测肿瘤异质性,指导免疫检查点疗法(如EGFR/KRAS突变检测)。传统技术如ddPCR(微滴式数字PCR)和NGS(二代测序)虽已获批临床,但存在设备昂贵(最高98.5万美元)、耗时长(5–14天)等局限。而Cas13无需PAM(原间隔序列邻近基序)的特性,结合其反式切割活性,可在37–42°C条件下实现超灵敏RNA检测,成本仅0.5–5美元。

Modification and optimization of CRISPR Cas13 reaction system

Cas13系统通过等温扩增技术(如RPA、LAMP)预放大靶标核酸,结合crRNA激活其切割活性。优化策略包括:

  1. 1.

    crRNA设计:针对不同PFS(原间隔序列侧翼)偏好性调整序列;

  2. 2.

    多酶联用:如Cas13与Cas12a协同提升检测范围;

  3. 3.

    设备整合:荧光信号、试纸条与POCT(即时检测)设备联用,使灵敏度达aM(10?18M)级。

Application in non-invasive dynamic detection

Cas13在液体活检中的应用涵盖:

  • CTC检测:通过上皮标志物(如EpCAM)捕获并分析突变基因;

  • ctDNA分析:靶向EGFRT790M等驱动突变;

  • EV研究:检测肿瘤特异性miR-21等非编码RNA。例如,SHERLOCK(特异性高灵敏度酶报告解锁)平台可在1小时内完成SARS-CoV-2筛查,其原理可迁移至肿瘤标志物检测。

Conclusion and Perspectives

Cas13技术凭借快速、低成本的优势,有望突破液体活检的临床推广瓶颈。未来需解决脱靶效应、体内递送效率等问题,并探索与AI(人工智能)结合的自动化分析系统。其应用将不仅限于癌症,还可拓展至感染性疾病和遗传病筛查。

(注:全文严格基于原文内容缩编,未添加非文献依据的结论。)

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