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综述:利用CRISPR-Cas系统开发即时诊断应用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月19日 来源:TrAC Trends in Analytical Chemistry 11.8
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这篇综述系统阐述了CRISPR-Cas系统在分子诊断领域的革命性应用,重点探讨了如何克服样本处理、试剂稳定性和成本效益等关键挑战,以推动其向符合WHO的ASSURED标准(快速、灵敏、设备简化)的即时检测(POC)和家庭诊断转化。文章深入分析了CRISPR-dx技术在非核酸靶标检测、冻干保存(lyophilization)和多重检测(multiplexing)等方面的最新突破。
CRISPR诊断技术的突破与挑战
Abstract
CRISPR系统通过其基因编辑能力彻底改变了生命科学领域,而Cas12/Cas13等酶的转切割(trans-cleavage)特性进一步推动了分子诊断技术的发展。这类技术具备速度快、特异性强、可编程和多重检测等优势,但在转化为商业化即时诊断产品时仍面临样本前处理、试剂稳定性和成本控制的瓶颈。
Introduction
早期疾病检测依赖核酸测试(NAT),但传统PCR技术对设备和人员要求高,等温扩增技术又易产生非特异性信号。世界卫生组织提出的ASSURED标准(经济、灵敏、特异、易用、快速、免设备、可及)为诊断技术发展指明方向。CRISPR系统凭借其天然核酸识别机制,尤其是Class II型Cas12(靶向DNA)和Cas13(靶向RNA)的转切割活性,成为满足这些标准的理想候选。
Amplification-free CRISPR-based diagnostics
部分Cas效应物可在皮摩尔(picomolar)浓度下直接检测基因组DNA、miRNA和mRNA,避免了核酸预扩增导致的误差。例如,Cas13通过设计特定crRNA实现了对SARS-CoV-2 RNA的高灵敏度检测,而Cas12被用于癌症突变位点的识别。
Limitations of CRISPR-based diagnostics
尽管SHERLOCK等技术已获批临床应用,但冷链运输(cold-chain)和试剂稳定性仍是POC推广的主要障碍。此外,复杂样本(如全血)的前处理步骤尚未完全简化。
Lyophilization
冻干技术可解决酶和crRNA的常温保存问题。研究表明,添加海藻糖等保护剂能显著提升冻干Cas蛋白的活性保留率,使其在40°C下稳定储存超过30天。
Expansion for non-nucleic acid targets
通过结合适配体(aptamer)或抗体,CRISPR系统已拓展至小分子、蛋白质和外泌体检测。例如,将ATP适配体与crRNA串联,使得Cas12能间接检测ATP浓度。
Outlook
未来需整合微流控(microfluidics)和智能手机读值技术,实现“样本-结果”全流程自动化。随着冻干工艺和信号放大方法的优化,CRISPR诊断有望成为资源有限地区的游戏规则改变者。
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