海洋热浪胁迫下黄条鰤幼鱼microRNAs的鉴定及其在热应激响应中的调控机制

本研究通过整合mRNA和miRNA测序数据，揭示了黄条鰤（Seriola dumerili）响应海洋热浪（MHWs）的关键调控网络。研究发现短时和反复热浪分别导致58/67个差异miRNAs和2313/3804个差异基因（DEGs），其中miR-195-x、miR-203-y等通过调控抗氧化、蛋白质折叠（HSPs）和免疫代谢通路（KEGG）介导热应激适应，为海水养殖抗逆品种培育提供分子靶点。

　　

Highlight

全球变暖加剧背景下，海洋热浪（MHWs）对鱼类生存构成严峻挑战。本研究首次绘制了黄条鰤响应MHWs的miRNA-mRNA互作图谱，发现反复热浪导致更多基因下调（vs短时热浪），提示持续高温造成不可逆损伤。

关键发现

1. 测序数据：获得4组样本共51.72M clean tags，鉴定889个miRNAs；转录组测序产出142,613.81M clean data

2. 差异表达：短时热浪组（CG-4d vs EG-4d）检出58个DE miRNAs和2313个DEGs；反复热浪组（CG-13d vs EG-13d）则发现67个DE miRNAs和3804个DEGs

3. 调控网络：构建7035对miRNA-mRNA互作关系，揭示miR-14-y通过抑制热休克蛋白（HSP70）编码基因加剧细胞损伤

4. 通路分析：GO/KEGG富集显示DEGs显著集中于氧化磷酸化（oxidative phosphorylation）、糖酵解（glycolysis）和MAPK信号通路

讨论

反复热浪引发的基因表达"代偿失调"现象尤为突出——代谢通路（如三羧酸循环）关键酶基因大规模下调，而内质网应激（ER stress）相关蛋白折叠通路持续激活。这解释了实验组在32°C下存活率骤降至65%的分子机制。

结论

本研究锁定miR-195-x/miR-203-y等核心调控因子，其通过"代谢-免疫-蛋白质稳态"三联调控轴影响黄条鰤热耐受性，为南海网箱养殖抗高温品种选育提供理论依据。