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细胞外基质相关基因LAMA4构建的宫颈癌预后模型:免疫治疗响应的潜在生物标志物
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月14日 来源:Frontiers in Oncology 3.3
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本研究通过整合TCGA-CESC和GEO数据集,首次构建了基于细胞外基质相关基因(ERGs)的宫颈癌(CC)预后模型,鉴定出LAMA4作为核心枢纽基因。研究发现LAMA4高表达与患者不良预后显著相关(p<0.001),并通过单细胞测序(scRNA-seq)和空间转录组证实其在肿瘤微环境(TME)中特异性富集于成纤维细胞。临床队列验证显示,LAMA4可作为PD-1/PD-L1免疫检查点抑制剂(ICI)治疗响应的预测指标(AUC=0.82),为宫颈癌精准治疗提供新靶点。
宫颈癌(CC)作为女性健康重大威胁,其治疗瓶颈在于缺乏有效预后标志物。细胞外基质(ECM)重构已被证实参与多种恶性肿瘤进展,但ERGs在CC中的系统研究仍属空白。本研究通过多组学分析揭示ERGs网络在CC中的调控机制,特别聚焦层粘连蛋白α4(LAMA4)的生物学功能与临床价值。
研究整合TCGA-CESC和GEO(GSE63514/GSE14404)数据集,筛选568个ERGs进行差异表达分析。采用共识聚类(ConsensusClusterPlus)划分CC亚型,LASSO-Cox回归构建预后模型。通过STRING数据库构建蛋白质互作网络(PPI),cytoHubba插件鉴定枢纽基因。临床验证纳入73例CC患者组织样本,采用免疫组化(IHC)和qPCR检测LAMA4表达,并分析其与免疫治疗响应的关联。
ERGs表达模式解析
热图分析显示ERGs在CC中呈现显著差异表达(log2FC>1,FDR<0.05),KEGG富集于ECM-受体相互作用通路(p=3.2×10-6)。PPI网络鉴定出20个核心基因,其中LAMA4的MCC评分最高(评分=4,892)。
分子分型与预后模型
共识聚类将患者分为Cluster A/B两型,Cluster A显示更差总生存期(OS,p=0.002)且富集于黏着斑通路。4基因(ANGPTL6/POMZP3/LAMA4/RELN)预后模型的5年AUC达0.79,高风险组死亡风险增加2.3倍(HR=2.3,95%CI 1.7-3.1)。
LAMA4的生物学机制
单细胞测序揭示LAMA4在成纤维细胞中特异性高表达(p<0.001)。空间转录组显示其表达与巨噬细胞浸润呈负相关(r=-0.62)。临床样本验证LAMA4在T2-4期表达显著高于T1期(p=0.003),高表达患者中位OS缩短14个月。
免疫治疗响应预测
IMvigor210队列分析显示,LAMA4高表达患者对PD-L1抑制剂atezolizumab响应率降低43%(p=0.008)。本院55例接受ICI治疗患者中,非响应组(SD/PD)LAMA4 IHC评分较响应组(CR/PR)高2.1倍(p=0.002)。
研究发现LAMA4可能通过双重机制促进CC进展:① 胞外通过整合素-FAK信号通路介导EMT过程;② 核内可能作为转录辅助因子调控基因表达。其介导的ECM硬化可形成物理屏障导致免疫排斥,这解释了其与ICI治疗响应的负相关性。
该研究不仅建立了首个CC特异性ERGs预后模型,更揭示LAMA4作为预测免疫治疗响应的潜在靶点。后续研究将利用类器官模型验证LAMA4调控CC转移的具体分子机制。
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