单细胞转录组学揭示RNA假尿苷化相关基因NHP2促进葡萄膜黑色素瘤进展的机制及其体内外验证

本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）结合TCGA数据库分析，首次揭示RNA假尿苷化（RNA-Ψ）关键基因NHP2在葡萄膜黑色素瘤（UM）中的促癌作用。实验证实NHP2通过调控细胞增殖、迁移和凋亡驱动UM进展，其高表达与患者不良预后显著相关，并构建了基于NHP2相关分子亚型的精准预后模型，为UM靶向治疗提供新思路。

　　

Highlight

单细胞注释鉴定出UM组织中的八种细胞类型

我们采用SCTransform方法对11个UM单细胞样本进行标准化，并通过Harmony算法整合样本以消除批次效应。结果显示样本间整合效果良好（图1A），原发瘤组与转移瘤组样本也实现有效整合（图1B）。后续通过细胞异质性分析和单细胞注释，成功绘制UM肿瘤微环境细胞图谱。

讨论

实体瘤是由恶性细胞与非恶性细胞组成的复杂生态系统，其瘤内异质性（ITH）对UM诊疗策略优化至关重要。单细胞RNA测序（scRNA-seq）为解析这种异质性提供了强大工具，能在单细胞层面捕捉转录组变异特征，揭示UM进展、复发和治疗抵抗的分子机制。

结论

综上，我们通过整合scRNA-seq和bulk RNA-seq分析，首次明确RNA假尿苷化相关基因NHP2是UM预后的关键调控因子。NHP2在UM中异常高表达，通过促进细胞增殖、迁移/侵袭并抑制凋亡加速疾病进展。基于NHP2构建的分子分型体系可有效预测患者生存率和转移风险，其中预后基因NENF、ILKAP和SRD5A3在UM临床样本中的高表达已获实验验证，提示NHP2是极具潜力的UM治疗靶点。