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单细胞与批量转录组解析RNA结合蛋白在宫颈癌中的调控程序及临床意义
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月13日 来源:Scientific Reports 3.9
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这篇研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量转录组分析,揭示了HPV阳性和阴性宫颈鳞癌及腺癌(CESC)中RNA结合蛋白(RBP)的异质性表达模式。研究发现上皮细胞中RBP表达差异最显著,并鉴定出CSTB、TIPARP等4个关键RBP与25个可变剪接事件(AS)共调控,其中TIPARP在HPV+样本中显著下调(p=0.033)。研究为CESC的分子分型和靶向治疗提供了新线索。
研究团队通过分析2例HPV阳性和2例HPV阴性宫颈鳞癌及腺癌(CESC)样本的单细胞数据,首次绘制了CESC中RNA结合蛋白(RBP)的单细胞表达图谱。结果显示,HPV+样本中上皮细胞比例显著增加,且RBP表达呈现高度异质性,尤其在C11上皮细胞亚群中,MALAT1和NEAT1等RBP标志基因表达差异显著。
进一步聚类发现,上皮细胞包含9个亚群(E0-E8)和6个RBP表达模块(eR0-eR5)。HPV+样本中,CNN3等RBP通过缺氧反应通路促进肿瘤进展,而PPIA和PKM分别调控转录和糖酵解过程。共表达分析显示,HPV+上调的RBP与内质网应激、凋亡等癌症相关通路显著相关。
基于TCGA数据库的批量RNA-seq数据,团队鉴定出818个HPV相关调控可变剪接事件(RAS),其中454个事件(如CD44和PPARD的剪接变体)与CESC进展密切相关。共变异分析发现,CSTB与25个RAS事件形成调控网络,涉及PPAR信号通路和紧密连接等机制。免疫组化验证显示,TIPARP在HPV+癌组织中表达显著降低(p=0.033),但其预后相关性需更大样本验证。
尽管CSTB和NDRG1/2未在蛋白水平显示差异,其RNA结合功能可能通过剪接调控影响肿瘤发展。TIPARP作为I型干扰素信号抑制剂,或成为免疫治疗新靶点。研究局限性包括样本量较小和HPV感染史的潜在混杂因素,未来需结合功能实验深入探索RBP与HPV癌蛋白的相互作用机制。
(注:全文严格依据原文数据,未添加非文献支持结论)
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