耐酸性脱卤球菌NK株全基因组解析：揭示低pH环境下有机卤化物呼吸的分子机制

来自中国的研究团队针对传统脱卤球菌(Dehalococcoides mccartyi, Dhc)仅在中性环境生长的局限，成功分离出首例耐酸性Dhc strain NK。该菌株在pH 5.5条件下仍能高效将四氯乙烯还原为乙烯，其1.51 Mb基因组包含13个完整rdhA基因及多个耐酸相关基因，为污染场地酸性条件下的生物修复提供新策略。

　　

在微生物王国里，脱卤球菌(Dehalococcoides mccartyi, Dhc)堪称"氯代烃终结者"，这类严格厌氧菌能通过有机卤化物呼吸(organohalide respiration)将有毒氯代烃转化为无害产物。但传统Dhc菌株都是"娇气"的中性菌(pH 6.0-8.0)，直到科学家从德国内卡河沉积物中"钓"出了另类选手——strain NK。

这个"酸坛子"高手在pH 5.5的酸性环境中，依然能把四氯乙烯(PCE)一路"脱衣"成乙烯。研究人员动用基因组测序"双保险"：Illumina短读长(150 bp PE)结合PacBio HiFi长读长(_N50=9,907 bp)，像拼图大师般用OPERA-MS混合组装出1.51 Mb的环状基因组。

基因"解剖"发现其藏着13把"分子剪刀"——完整型还原脱卤酶(rdhA)基因，还有质子泵、分子伴侣等"抗酸装备"。有趣的是，虽然16S rRNA基因与经典菌株195号100%相同，但基因组里却找不到已知的耐酸基因，暗示Dhc可能进化出了全新的"酸生存指南"。这项发现为酸性污染场地的生物修复送来"特种兵"，也让科学家对微生物的环境适应力有了新认识。