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从新加坡褐藻Sargassum ilicifolium中分离的Marinobacter salsuginis SSi115基因组揭示其T6SS系统与生物修复潜能
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月12日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.6
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来自新加坡的研究团队通过对褐藻共生菌Marinobacter salsuginis SSi115的基因组解析,发现其携带VI型分泌系统(T6SS)关键基因簇(vgrG/hcp等)和脱氮(narG/norB/nosZ)、烃类降解(xylC/dmpK)通路基因,揭示了该菌株在海洋生态互作与生物修复中的双重功能,为海洋微生物资源开发提供新思路。
在热带岛屿的褐藻表面,科学家们捕获了一株颇具潜力的海洋细菌——Marinobacter salsuginis SSi115。这株从新加坡圣约翰岛采集的Sargassum ilicifolium藻体表面分离的菌株,经过55°C热激处理和海洋培养基筛选后,其基因组秘密通过Illumina HiSeq X Ten平台(150bp双端测序)被成功破译。
组装完成的4.35Mb基因组藏着令人惊喜的武器库:完整的VI型分泌系统(T6SS)基因簇包括vgrG、hcp等核心组件,这些分子矛枪可能帮助其在藻际环境中"开疆拓土"。更引人注目的是,基因组中潜伏着narG/norB/nosZ等脱氮途径基因,以及xylC/dmpK等烃类降解基因,暗示着这株小小的海洋细菌可能是位"环境清洁工"。
通过平均核苷酸一致性(ANI>95%)和数字化DNA-DNA杂交(dDDH>70%)分析,研究人员确认其与M. salsuginis 5N-3的亲缘关系。18个contigs组成的基因组中,57.3%的GC含量和3,962个编码基因,勾勒出这个海洋微生物的生存策略。特别值得注意的是,那些参与单环芳烃降解的基因,让这个发现于新加坡海域的菌株可能成为未来海洋石油污染治理的潜力股。
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