母乳源婴儿长双歧杆菌JNU311全基因组测序揭示其益生功能与工业应用潜力

【字体: 时间:2025年08月12日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.6

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  来自韩国的研究人员针对母乳喂养婴儿肠道菌群关键成员——婴儿长双歧杆菌(Bifidobacterium longum subsp. infantis)开展全基因组测序研究,成功解析菌株JNU311的2,610,619 bp环形基因组结构(GC含量59.76%),鉴定2,306个编码序列及70个RNA基因,为开发新型益生菌制剂提供重要基因组学基础。

  

在母乳喂养婴儿的肠道微生态系统中,婴儿长双歧杆菌(Bifidobacterium longum subsp. infantis)扮演着核心角色——不仅能促进免疫系统成熟、维持免疫平衡以抑制炎症反应,还能增强肠道屏障功能并提升乙酸(acetate)产量。这项研究聚焦于从韩国光州1月龄母乳喂养婴儿粪便中分离的JNU311菌株,采用创新性的混合测序策略:结合牛津纳米孔GridION平台的长读长测序(N50达7,471 bp)与Illumina NextSeq2000的短读长测序,最终获得覆盖深度达517.725×的高质量环形基因组。

经生物信息学分析显示,该菌株基因组呈现典型双歧杆菌特征——2.61 Mb的环状染色体携带59.76%的GC含量,包含2,306个蛋白质编码基因及58个tRNA、12个rRNA。特别值得注意的是,通过BUSCO评估显示89.6%的放线菌纲保守基因完整存在,暗示其具备完整的代谢网络。研究人员采用特殊培养基(含新霉素、巴龙霉素和氯化锂的BL培养基)进行厌氧培养,并通过16S rRNA基因测序(GenBank登录号PV849150)确认其分类地位。这些发现为深入解析该菌株降解母乳低聚糖(HMO)的分子机制,以及开发针对婴幼儿肠道健康的下一代益生菌产品奠定了重要基础。

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