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基于无人机语义分割与地面样本距离驱动像素-面积映射的高通量小麦幼苗表型分析
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月12日 来源:Computers and Electronics in Agriculture 8.9
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为解决传统小麦幼苗面积估算方法精度低、劳动强度大、复杂田间条件下可扩展性差等问题,南京农业大学的研究团队开发了集成Wheat Seedling Former语义分割与Ground Sample Distance空间转换的像素-面积表型分析框架。该研究通过三阶段预处理流程和改良网络架构,实现了幼苗覆盖率与生长活力的高通量量化,在160块试验田中获得与真实测量值0.942的皮尔逊相关系数,误差<3%,并开发了自动化表型提取工具使分析时间减少65%,为加速抗逆小麦品种选育提供了创新方案。
在保障全球粮食安全的紧迫背景下,小麦幼苗早期生长监测面临三大技术瓶颈:传统人工网格采样存在主观误差,地面传感器难以大规模应用,而现有无人机影像分析方法对重叠叶片、土壤干扰等复杂场景适应性不足。尤其在小麦分蘖期(播种后20-40天),幼苗叶片仅5-15厘米且呈簇状分布,其细微形态特征(如叶缘形态、分蘖位点)与抗逆性密切相关,但现有成熟作物分析模型难以捕捉这些关键细节。
南京农业大学前沿交叉研究院的研究团队在《Computers and Electronics in Agriculture》发表的研究中,创新性地提出Wheat Seedling Former(WSF)分析框架。该研究通过融合多光谱成像与计算机视觉技术,开发出首个针对小麦幼苗期特化的表型分析系统,实现了从像素级识别到田间尺度评估的全流程创新。
研究团队采用三大核心技术:首先建立包含线性回归色彩校准、超绿通道(ExG)分割和各向异性扩散滤波的预处理流程,解决土壤反射干扰问题;其次构建具有空间-通道双注意力(SCSA)和跨层特征金字塔(CFPT)的语义分割网络,提升细小结构识别能力;最后通过Ground Sample Distance(GSD)空间转换算法,将像素计数转化为实际面积,并整合NDVI、NDRE等6项光谱指标。所有实验基于160个田间小区(0.8×0.8米)的低空无人机影像(飞行高度4米,GSD≤2厘米)开展。
【多尺度图像采集与预处理】
研究团队在南京白马教学科研基地(31°36′57.8″N, 119°10′46.1″E)设置系统排列的试验田,通过改进的滑动窗口数据增强技术将原始160幅图像扩展至11,200张训练样本。独特的Hanning窗口变换融合算法有效解决了图像拼接时的边缘失真问题。
【WSF架构优化】
相比主流的DeepLabv3+和U-Net模型,集成SCSA-CFPT-ASPP模块的WSF网络在测试集达到92.2%的精确度和91.3% mIoU。其中SCSA模块通过并联空间注意力(SMSA)和通道注意力(PCSA)分支,使背景干扰区域的误判率降低37%;而CFPT模块通过跨层特征融合,对叶尖等亚像素级特征的检测灵敏度提升2.3倍。
【表型参数提取】
基于GSD的空间转换方法将面积估算误差控制在±0.5 m2以内。通过凸包算法计算的紧凑度指标,成功区分出35个高活力基因型(冠层闭合度≥90%),其干旱耐受性比低活力组高28%。研究同步开发的Seedling Phenotype Extractor软件实现表型参数自动化提取,处理效率提升65%。
【机器学习辅助基因型筛选】
随机森林模型整合六项表型指标后,发现NDRE与FVC的组合对基因型分级效果最优(准确率89%)。高活力基因型在NDVI(0.68±0.12)和冠层紧凑度(0.91±0.04)上均显著优于其他组别(p<0.01),证实早期表型特征与抗逆性存在强关联。
该研究的突破性在于首次实现小麦幼苗多维度表型的无损精准评估,建立的WSF模型在未管理田块的泛化测试中仍保持82.7%的准确率。研究者特别指出,CFPT模块对弱光条件下新生芽的检测性能超越人工标注,这种"超视力"特性为作物早期逆境响应研究开辟新途径。未来通过接入云计算平台,该技术有望将单次田间表型分析时间压缩至1小时以内,为智慧育种提供核心工具支撑。
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