Protankyra verrilli线粒体全基因组测序揭示海参纲Apodida目系统发育新证据

来自中国的研究团队首次完成海参纲Apodida目物种Protankyra verrilli的线粒体全基因组测序（16,970 bp），揭示其包含13个PCGs、22个tRNAs（含trnL/trnS重复）及2个rRNAs的独特结构。通过13个蛋白编码基因的系统发育分析，证实该物种与Euapta godeffroyi存在密切进化关联，为海洋无脊椎动物分类学提供了重要分子标记。

　　

在北部湾23.3米深处采集的棘皮动物Protankyra verrilli（标本编号IDXB3）揭开了其线粒体基因组的奥秘。这项研究采用Illumina NovaSeq6000平台进行双端测序，经SPAdes组装获得16,970 bp的环状基因组，AT含量高达64.38%。值得注意的是，基因组中检测到trnL和trnS基因的重复现象，且细胞色素b（cytb）、12S rRNA等9个tRNA基因位于轻链（L-strand）。

通过MAFFT比对13个蛋白编码基因的氨基酸序列，结合Gblocks过滤可变区域，构建的ML/NJ系统发育树（bootstrap值98-100）清晰显示：P. verrilli与同科物种Euapta godeffroyi形成稳定分支，支持Apodida目在海参纲中的单系性。基因顺序比较发现，该物种与近缘种存在tRNAs和3个PCGs的显著重排现象。

这项研究不仅填补了Protankyra属遗传信息的空白，其GenBank登录号ON018239的基因组数据，更为海洋生物谱系地理学和隐存种鉴定提供了关键分子工具。研究过程严格遵循生物伦理规范，所有样本采集均符合国际公约要求。