LPS和poly(I:C)感染下鳜鱼皮肤免疫防御机制的转录组学研究

本研究通过转录组分析揭示了鳜鱼(Siniperca chuatsi)皮肤在LPS（细菌模拟物）和poly(I:C)（病毒模拟物）刺激下的免疫防御机制，鉴定出MAPK信号通路和细胞因子-受体互作通路的关键调控作用，其中jun基因作为枢纽基因协调免疫应答。该研究为鱼类黏膜免疫（SALT）提供了分子层面的见解，对开发水产疫苗具有重要指导意义。（注：含DEGs、LPS、poly(I:C)、MAPK等专业术语）

　　

Highlight

本研究通过短时程RNA测序技术，系统解析了鳜鱼皮肤在细菌（LPS）和病毒（poly(I:C)）模拟物刺激下的转录组动态变化。

RNA-seq数据概览

每个样本获得21-26百万条原始读数，经质控后清洁读数保留率达98.6%以上。GC含量稳定在45%左右，基因组比对率高达94.2-95.6%，注释覆盖率84.2-86.5%（详见补充材料1）。

讨论

MAPK信号通路（含dusp1/2/5/8a、jun家族基因等）和细胞因子互作通路（含tnfrsf9/10b/12a、il1b等）被显著激活。其中jun基因在蛋白互作网络中呈现枢纽特性，可能通过调控下游炎症因子（如il1b）协调先天免疫应答。

结论

该研究首次绘制了鳜鱼皮肤免疫的转录组图谱，揭示MAPK通路在鱼类黏膜防御中的核心地位，为开发靶向jun基因的水产疫苗提供了理论依据。