乌苏里拟鲿脾脏转录组揭示poly(I:C)和LPS免疫应答差异机制及其在水产抗病育种中的应用价值

本研究通过乌苏里拟鲿(Pseudobagrus ussuriensis)脾脏转录组测序，解析了细菌LPS和病毒模拟物poly(I:C)刺激下差异表达基因(DEGs)的动态变化，发现ECM-受体互作和细胞因子通路是核心响应通路，鉴定出B型凝集素、CDK17等关键免疫调控基因，为鱼类抗病机制研究和疫苗开发提供新靶点。

　　

在水产养殖业面临病原体威胁加剧的背景下，乌苏里拟鲿(Pseudobagrus ussuriensis)作为中国特有经济鱼种，其细菌性和病毒性疾病防控成为产业痛点。山西农业大学动物科技学院的研究团队在《Aquaculture and Fisheries》发表重要成果，通过脾脏转录组分析揭示了该物种对细菌脂多糖(LPS)和病毒模拟物poly(I:C)的差异化免疫应答机制。

研究采用Illumina HiSeqTM 2500平台进行转录组测序(RNA-seq)，对LPS和poly(I:C)刺激后0/3/12/24 h的脾脏样本进行时序分析。通过Trimmomatic质控、Trinity2组装和STEM聚类，结合DESeq2差异分析筛选关键基因，并利用qPCR验证B型凝集素等标志物的表达模式。

结果部分显示：3.1节中146.64G clean data的测序质量(Q30>94.6%)为后续分析奠定基础；3.2-3.4节时序分析发现LPS组共享34个DEGs而poly(I:C)组达816个，均富集于细胞因子-受体互作通路；3.5节PPI网络揭示CD48和SLAMF8是LPS响应的核心节点；3.6节则鉴定出RIG-I和IFI44等抗病毒关键基因；3.7节发现B型凝集素等10个基因对两种刺激均有响应；3.8节qPCR验证CDK17等基因的震荡表达模式。

讨论部分强调，该研究首次系统描绘了乌苏里拟鲿脾脏免疫转录图谱：LPS通过TLR4-NF-κB-CD48轴激活抗菌反应，而poly(I:C)通过RIG-I/MDA5-JAK-STAT-IFI44级联诱发抗病毒状态。特别值得注意的是ECM-受体互作通路在两种刺激中的枢纽地位，提示细胞外基质重构是鱼类免疫防御的保守机制。研究成果为开发分子标记辅助育种技术和新型疫苗提供了理论依据，对保障我国特色水产资源可持续发展具有重要实践价值。