高原型藏羊与扎什加羊全基因组选择性清除分析：揭示适应、生长及肉用性状的遗传机制

本文通过全基因组选择性清除分析（Fst、Pi和Tajima's D方法），系统研究了高原型藏羊（PT）与扎什加羊（ZS）的遗传差异，鉴定出HBB、HOX基因家族、BMP4等关键基因与高原适应、生长发育及肉品质相关。研究揭示了氨基糖代谢、花生四烯酸代谢等通路在藏羊育种中的重要作用，为优质肉羊品种选育提供了分子依据。

　　

Highlight

本研究采用双方法学策略（Fst/Pi联合分析、Pi/Tajima's D交叉验证），首次系统解析了高原型藏羊与扎什加羊的基因组选择特征。发现血红蛋白基因（HBB/HBE1）、抗氧化基因（GPX1）和发育调控基因（HOX家族）在高原适应中起核心作用，其中SIRT3和BMP4基因可能通过调控能量代谢和骨骼发育影响羊只体型差异。

Genetic signature of positive selection in Tibetan sheep

选择信号分析显示：ZS群体的核苷酸多样性指数（Pi）显著低于PT群体（图1），表明其经历了更强的人工选择压力。群体分化指数（Fst）均值<0.2（图2）提示两群体间存在适度遗传分化。Tajima's D分析揭示多个基因区域偏离中性进化，包括与脂肪沉积相关的PLAAT3和肌肉发育调控因子MRAP2。

Discussion

动物驯化过程中，藏羊通过HBB基因突变（如HBE1）增强高原缺氧适应能力，HOXB簇基因可能通过调控胚胎发育影响体型差异。特别值得注意的是，线粒体去乙酰化酶SIRT3与能量代谢通路（如碳代谢）的协同进化，可能是扎什加羊肉质优化的关键分子基础。

Conclusions

本研究构建了藏羊重要经济性状的基因-通路网络，其中MMAB（维生素B₁₂代谢）和P4HTM（胶原合成）等新靶点的发现，为分子标记辅助育种提供了理论支撑。这些发现不仅阐明高原家畜适应性进化机制，也为优质肉羊品种选育开辟了新思路。