质子给体(异)香草醛片段对噻唑并[3,2-a]嘧啶-2-芳亚甲基衍生物晶体堆积的影响及其生物活性研究

【字体: 时间:2025年08月09日 来源:Journal of Molecular Structure 4.7

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  本文通过X射线衍射(XRD)、振动光谱(IR/Raman)和量子化学计算(DFT/B3LYP/6-311G(d,p)),揭示了羟基取代位点差异对噻唑并嘧啶衍生物1(3-羟基-4-甲氧基)与2(4-羟基-3-甲氧基)晶体堆积的显著影响:前者形成外消旋二聚体,后者构建交替R/S对映体氢键链。分子轨道分析(HOMO-LUMO)显示二者电子特性差异,其跨膜能力暗示潜在胰岛素阻断剂开发价值。

  

Highlight

质子给体(异)香草醛片段通过调控氢键网络,显著影响噻唑并[3,2-a]嘧啶-2-芳亚甲基衍生物的晶体堆积模式。化合物1(3-羟基-4-甲氧基)形成中心对称的外消旋二聚体,而异构体2(4-羟基-3-甲氧基)则通过交替R/S对映体构建一维氢键链。这种结构差异源于羟基位置变化导致的质子给体-受体空间重组。

Structural analysis

基于DFT/B3LYP/6-311G(d,p)方法优化的结构显示,噻唑环近乎平面而嘧啶环轻微扭曲。X射线晶体学证实,化合物1中羟基与相邻分子甲氧基形成O-H···O氢键(键长2.68 ?),而化合物2通过羟基-吡啶氮原子相互作用(键长2.72 ?)延伸为超分子链。有趣的是,两种晶体中芳亚甲基片段均呈现Z-构型,且噻唑环与苯环的二面角差异(1: 8.3° vs 2: 12.7°)暗示共轭程度变化。

Conclusion

首次解析的两种芳亚甲基噻唑并嘧啶晶体结构表明:3-羟基-4-甲氧基片段倾向形成二聚体"分子锁",而4-羟基-3-甲氧基异构体则组装成"分子拉链"链状结构。分子前线轨道分析揭示,化合物1的HOMO定域于芳亚甲基(电离能5.42 eV),而2的HOMO分布于噻唑-嘧啶骨架(电离能5.18 eV),这种电子分布差异与其抑制癌细胞增殖的in vitro活性正相关。研究为理性设计靶向胰岛素信号通路的小分子提供了结构基础。

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