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急性心肌梗死中中性粒细胞相关生物标志物的鉴定与验证:基于RNA-seq、eQTL和孟德尔随机化的整合分析
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月08日 来源:Frontiers in Molecular Biosciences 4
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这篇研究通过整合分析RNA-seq、表达数量性状位点(eQTL)和孟德尔随机化(MR)数据,揭示了中性粒细胞与急性心肌梗死(AMI)的因果关联,并鉴定出BCL6、CDA和IL1R2三个关键基因。研究不仅构建了诊断模型(AUC=0.933),还通过免疫浸润分析和分子对接验证了靶点潜力,为AMI的免疫治疗提供了新思路。
急性心肌梗死(AMI)是一种由冠状动脉阻塞导致心肌坏死的致命性疾病,中性粒细胞浸润是其关键病理特征。尽管既往研究提示中性粒细胞通过释放活性氧(ROS)和中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)加剧心肌损伤,但其因果关联和分子机制尚不明确。
研究整合了基因表达综合数据库(GEO)的RNA-seq数据、OpenGWAS的eQTL和中性粒细胞数据,采用CIBERSORT评估免疫细胞浸润,并通过孟德尔随机化(MR)验证因果关系。加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选模块基因,LASSO和随机森林(RF)算法进一步锁定枢纽基因。体外实验通过氧糖剥夺(OGD)模型验证基因表达。
免疫图谱与因果关联:
AMI样本中中性粒细胞、单核细胞和M2巨噬细胞浸润显著增加(P< 0.01)。
MR分析显示中性粒细胞是AMI的独立风险因素(OR=1.628,95% CI: 1.433–1.850)。
关键基因与通路:
筛选出30个中性粒细胞共表达基因,功能富集显示其与NF-κB和IL-17信号通路密切相关。
枢纽基因BCL6、CDA和IL1R2在AMI组表达显著上调(P< 0.001),诊断价值高(AUC>0.89)。
分子机制与治疗潜力:
eQTL分析证实BCL6是AMI的核心风险基因,可能通过调控MD2/NF-κB轴促进心肌损伤。
分子对接发现靶向药物(如阿那金拉)与枢纽基因结合能低(<-7.4 kcal/mol),提示治疗潜力。
研究首次通过多组学整合揭示了中性粒细胞在AMI中的因果作用,并构建了基于BCL6、CDA和IL1R2的预测模型。局限性包括样本来源单一和缺乏临床分期数据,未来需通过单细胞测序和动物实验进一步验证。
中性粒细胞通过BCL6等基因介导AMI进展,靶向干预其相关通路或为治疗提供新策略。
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