栖息地破碎化对智利南部普度鹿(Pudu puda)微卫星遗传结构与多样性的影响

本研究针对智利南部普度鹿(Pudu puda)面临的栖息地破碎化威胁，通过5个多态性微卫星位点分析20只地理定位个体的遗传多样性及分化参数。研究发现种群间遗传分化不显著(FST=0.0942)，但栖息地破碎化指标PLAND(景观森林覆盖率)和PD(斑块密度)与等位基因数(A)和观测杂合度(HO)呈显著负相关(β=-0.8740/-0.6594)，表明森林破碎化加剧导致遗传多样性降低，为制定该濒危物种保护策略提供重要依据。

　　

在智利南部苍翠的温带雨林中，栖息着世界上体型最小的鹿科动物之一——普度鹿(Pudu puda)。这种肩高仅30-40厘米的濒危物种，正面临栖息地破碎化的严峻挑战。随着人类活动扩张，原生森林被人工林和草地取代，岛屿化的栖息地是否会影响种群基因交流？遗传多样性是否会因此衰减？这些问题直接关系到该物种的长期生存。智利洛斯拉戈斯大学分子生物学与细胞遗传学实验室的研究团队在《NEOTROPICAL BIOLOGY AND CONSERVATION》发表的研究，通过前沿的景观遗传学方法揭示了这一生态过程背后的遗传学机制。

研究人员采用微卫星基因分型(5个多态性位点)、STRUCTURE群体结构分析(2.3.4版本)和NeEstimator有效种群大小计算等关键技术，对奥索尔诺、延基韦和奇洛埃三省20只地理定位个体进行检测，并结合FRAGSTATS景观格局分析量化栖息地破碎化指标。

遗传多样性分析显示：

• 等位基因丰富度：延基韦省种群最高(Ar=3.1)，显著高于奥索尔诺(2.5)和奇洛埃(2.5)

• 杂合度缺陷：所有种群均存在显著近交(F_IS=0.091-0.189, P<0.0001)，BM6506等位点偏离哈迪-温伯格平衡

• 群体分化：整体遗传分化指数F_ST为0.0942(P>0.05)，STRUCTURE分析未检测到亚群结构(K=2时Q值对称分布)

栖息地破碎化关联分析发现：

• 奇洛埃省破碎化最严重，斑块密度(PD=0.71/100ha)是奥索尔诺省的1.2倍

• 多元回归显示PD和PLAND与遗传参数显著负相关(调整R²=0.3222)，斑块密度每增加1单位，等位基因数降低0.6594个

讨论指出，尽管未形成显著遗传结构，但栖息地破碎化通过限制基因流动导致遗传多样性衰减，特别是奥索尔诺省有效种群大小(Ne=3)已低于维持遗传变异的理论阈值。该研究首次证实智利南部普度鹿面临"遗传瓶颈"风险，强调保护森林连通性对维持该物种进化潜力的关键作用，为制定生态廊道等保护措施提供分子生态学依据。研究团队建议将景观遗传学指标纳入该物种红色名录评估体系，这对其他栖息地特化型濒危哺乳动物的保护具有示范意义。