中国特有物种小巢鼠(Micromys pygmaeus)线粒体全基因组首次解析揭示巢鼠属(Micromys)系统发育新格局

来自中国的科研团队针对啮齿目鼠科巢鼠属新种小巢鼠(Micromys pygmaeus)的分类地位争议，通过完成该物种及近缘种M. minutus的线粒体基因组测序，首次发现nad6基因中35bp不完全重复序列(相似度90%)的特异结构变异。基于13个蛋白质编码基因的系统发育分析证实巢鼠属形成3个高支持度分支(后验概率>0.98)，并确立其与鼠族(Rattini)的姐妹群关系，为鼠亚科(Murinae)辐射演化提供重要分子证据。

　　

最新整合形态学、分类学和分子证据的研究提出，中国特有物种小巢鼠(Micromys pygmaeus)应被确立为巢鼠属(Micromys)新种。为验证这一分类假说的进化意义，研究者成功组装获得小巢鼠完整线粒体基因组，并同步测序其近缘种M. minutus的对应数据。比较基因组分析显示，该属物种保持高度保守的基因组结构(16,232-16,243bp)，具有相同的基因排列顺序、AT偏好性核苷酸组成及密码子使用模式。

引人注目的是，小巢鼠在nad6基因中发现独特的35bp不完全重复基序(周期长度15bp/拷贝数2.3/相似度90%)，这是巢鼠属线粒体基因组中首次报道的结构变异。采用贝叶斯推断和最大似然法对13个线粒体蛋白编码基因进行的系统发育重建，一致支持巢鼠属形成三个高置信度的进化分支(节点支持率：后验概率>0.98，自展值>95%)。拓扑结构分析进一步确认该属与鼠族(Rattini)存在姐妹群关系，这些发现为理解鼠亚科(Murinae)的辐射演化模式建立了可靠框架。