胃癌HIF-1信号通路中circRNA相关ceRNA网络的生物信息学解析及其临床转化潜力

【字体: 时间:2025年08月07日 来源:Horticultural Plant Journal 6.2

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  本文推荐语:本研究通过生物信息学方法构建了胃癌HIF-1信号通路中circRNA(环状RNA)相关的ceRNA(竞争性内源RNA)调控网络,揭示hsa_circ_0000348和hsa_circ_0004674作为核心分子通过吸附miRNA调控肿瘤侵袭转移关键基因,为胃癌分子标志物开发和靶向治疗提供新思路。

  

亮点聚焦

本研究采用CircNet 2.0数据库(整合circAtlas、MiOncoCirc和TCGA数据)对37种癌症的2700+样本进行circRNA分析,特别锁定胃癌中表达量前50的circRNAs,其中具有miRNA响应元件(MREs)的分子被重点筛选(详见表S1)。

胃癌中circRNA/miRNA/mRNA调控网络的HIF-1通路图谱

通过CircInteractome和mirPath v.3数据库,我们鉴定出106个同时参与HIF-1信号通路且能靶向circRNA上MREs的microRNAs(表S2,图4A)。这些分子构成动态调控网络,其中hsa_circ_0000348和hsa_circ_0004674表现出显著的"分子海绵"效应——它们通过竞争性结合共享miRNAs(如miR-107),释放下游促癌基因(如BDNF和LIN28)的表达,进而驱动胃癌化疗耐药和糖酵解重编程(Warburg效应)。

讨论

研究首次系统描绘了circRNA-ceRNA轴在胃癌HIF-1通路中的层级调控:核心circRNAs通过吸附miRNA调控血管生成因子(VEGF)、细胞外基质重塑酶(MMP9/uPA)和代谢转换关键蛋白(GLUT1/HK2/LDHA),这种"分子对话"机制为克服胃癌异质性和化疗耐药提供了全新视角。有趣的是,这些circRNAs还能影响SOX2和PTEN等转录因子的活性,形成正反馈环路放大促癌信号。

结论

hsa_circ_0000348/hsa_circ_0004674-miRNA-mRNA网络是胃癌HIF-1通路的关键调控层,其分子机制涵盖从表观遗传调控到代谢重构的多维度致癌过程。这些发现不仅为开发circRNA液体活检标志物奠定基础,更提示靶向ceRNA网络的"分子解耦"策略可能是未来精准治疗的新方向。

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