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RNF25-REV7信号轴:揭示DNA复制应激中叉保护的非经典机制及其在癌症治疗中的潜在价值
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月07日 来源:Nature Communications 15.7
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本研究针对DNA复制应激(DDR)中叉保护机制的关键问题,通过CRISPR-Cas9筛选发现RING指E3泛素连接酶RNF25通过非经典途径与REV7相互作用,保护HLTF介导的逆转复制叉免受MRE11/CtIP核酸酶降解。该发现揭示了独立于泛素信号通路的叉保护新机制,为靶向复制应激的癌症治疗策略提供了新靶点。
在细胞分裂过程中,DNA复制就像一场精密编排的交响乐,但各种内外因素常常打断这场演奏——这就是DNA复制应激。当复制叉遇到障碍时,细胞会启动复杂的DNA损伤应答(DDR)机制,其中叉逆转形成"鸡爪"结构是重要保护策略。然而这种逆转叉犹如双刃剑,其暴露的单链DNA(ssDNA)末端极易被核酸酶降解,导致基因组不稳定甚至细胞死亡。目前已知BRCA2、FANCD2等因子能保护逆转叉,但E3泛素连接酶在此过程中的作用仍是未解之谜。
来自美国北卡罗来纳大学教堂山分校(University of North Carolina at Chapel Hill)的研究团队在《Nature Communications》发表重要成果。通过创新的CRISPR-Cas9筛选,研究人员发现RING指E3泛素连接酶RNF25能通过与复制叉保护因子REV7的相互作用,形成全新的叉保护机制。令人惊讶的是,这一功能完全独立于RNF25经典的泛素信号传导活性,为理解复制应激应答开辟了新视角。
研究采用多项关键技术:1)针对317个RING指E3泛素/SUMO连接酶的CRISPR-Cas9筛选系统;2)胰腺导管腺癌(PDAC)细胞系Pa02C/Pa03C的WEE1抑制剂(AZD-1775)敏感性分析;3)单分子DNA纤维技术定量复制叉运动和降解;4)原位蛋白互作分析(SIRF)检测RNF25与新生DNA的共定位;5)免疫沉淀-质谱(IP-MS)鉴定RNF25相互作用蛋白网络。
【CRISPR筛选揭示RING指E3泛素/SUMO连接酶基因对WEE1i耐受的作用】
研究人员构建靶向317个E3连接酶的sgRNA文库,在PDAC细胞中筛选WEE1抑制剂耐受相关基因。通过Volundr算法分析发现,RNF25和PIAS1缺失显著增加细胞对WEE1i的敏感性。验证实验显示RNF25缺陷细胞在WEE1i处理后出现异常S期阻滞和G2/M期进入障碍。
【RNF25防止ssDNA积累并促进WEE1i处理细胞的S期和G2/M期进程】
RNF25缺失导致磷酸化RPA(pRPA)异常积累,表明ssDNA持续存在。活细胞成像显示RNF25缺陷细胞有丝分裂异常增加,多核细胞比例显著升高。这些现象与NF-κB、ERK信号通路无关,排除了RNF25已知功能的影响。
【RNF25与DNA复制因子相关】
IP-MS分析揭示RNF25与PARP1、TNKS1/2和REV7等复制相关蛋白存在相互作用。特别值得注意的是,RNF25能稳定REV7蛋白水平,这种相互作用在复制应激后进一步增强。
【RNF25保护逆转复制叉免受降解】
染色质分级实验显示HU处理后RNF25迅速募集到染色质。DNA纤维分析证实RNF25缺失导致复制叉降解加剧,这种表型可被MRE11或CtIP敲除挽救,而HLTF缺失则完全逆转叉降解,表明RNF25特异性保护HLTF介导的逆转叉结构。
【RNF25介导复制叉保护的结构基础】
通过构建系列RNF25结构域突变体,发现其RING结构域(而非E2结合活性)对叉保护至关重要。特别值得注意的是,破坏PAR结合位点(C198/201A)或E2结合位点(C135/138S)的突变体仍保留完整叉保护功能,证实该过程独立于泛素化活性。
【RNF25和REV7在DNA复制叉保护通路中的共同作用】
遗传学分析显示RNF25与REV7在功能上呈上位性。SIRF实验证明RNF25负责将REV7募集到新生DNA,且这种募集在复制应激时增强。TCGA数据分析显示RNF25与REV7在PDAC等多种肿瘤中存在表达相关性。
【RNF25与Polζ在DNA复制叉保护通路中的共同作用】
进一步研究发现RNF25与REV1-REV3L复合物(即Polζ)在同一通路中发挥作用,但与Shieldin复合物功能独立。值得注意的是,RNF25不参与Polζ依赖的Chk1磷酸化等其它功能,显示其作用的特异性。
这项研究揭示了RNF25-REV7信号轴作为细胞应对复制应激的新型保护机制。与传统认知不同,RNF25通过非催化性的支架作用,而非其E3泛素连接酶活性来实现叉保护功能。这一发现不仅拓展了对DNA复制应激应答的理解,更提供了潜在的治疗靶点——通过干扰RNF25-REV7相互作用可能增强肿瘤细胞对复制应激诱导剂(如WEE1抑制剂)的敏感性。研究还提出了有趣的生物学问题:RNF25如何协调其在翻译质量控制(依赖泛素化)与DNA复制(非依赖泛素化)中的双重角色?这些发现为开发选择性靶向RNF25叉保护功能的新型抗癌策略奠定了理论基础。
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