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线粒体亚型在肾缺血再灌注损伤中的作用:指导移植肾功能延迟恢复与长期移植物存活预测的新策略
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月07日 来源:Scientific Reports 3.9
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本研究针对肾移植中缺血再灌注损伤(IRI)导致的移植肾功能延迟恢复(DGF)和长期移植物存活率低的问题,通过分析线粒体相关基因(MGs)的表达特征,首次建立了基于分子亚型的DGF和长期预后预测模型。研究人员利用GEO数据库的RNA-seq和单细胞测序数据,鉴定出16个差异表达MGs(DE-MGs),将IRI患者分为炎症免疫激活型(C1)和代谢活跃型(C2)两个亚群,发现C1亚群DGF发生率显著更高。通过机器学习构建的5基因(DDIT3/MCL1/PPP1R15A/ANXA1/HSPA1B)DGF预测模型和4基因(ANXA1/DNAJA1/JUN/RGS2)长期存活预测模型均显示出优异效能。单细胞分析揭示肥大细胞(Mast cell)通过AREG-EGFR等配体-受体对介导细胞间通讯的关键作用。该研究为肾移植术后并发症的早期干预提供了新靶点。
肾移植是终末期肾病最有效的治疗手段,但供体器官短缺和移植后并发症仍是重大挑战。其中,缺血再灌注损伤(Ischemia-reperfusion injury, IRI)作为移植手术不可避免的环节,会引发炎症反应和氧化应激,导致高达30%的移植肾功能延迟恢复(Delayed graft function, DGF),并显著增加急性排斥和移植物失功风险。尽管已有研究关注线粒体功能障碍与慢性移植物损伤的关联,但如何利用线粒体相关基因(Mitochondrial-related genes, MGs)预测临床结局仍是未解难题。
针对这一空白,皖南医学院第一附属医院血液净化中心(Blood Purification Center, The First Affiliated Hospital of Wannan Medical College)的研究团队开展了创新性研究。通过整合多组学数据和人工智能算法,首次建立了基于线粒体分子特征的临床预测体系,相关成果发表在《Scientific Reports》。研究人员从GEO数据库获取4个肾移植队列(GSE43974/GSE90861/GSE126805/GSE21374)的转录组数据,采用差异表达分析筛选出16个IRI相关DE-MGs,通过共识聚类将患者分为C1(炎症/免疫激活型)和C2(代谢活跃型)亚群。利用LASSO回归构建DGF预测模型(AUC=0.759)和长期存活模型(4年预测AUC=0.841),并结合单细胞测序(GSE109564)解析细胞互作机制。
关键技术方法包括:1)从203例IRI和188例对照样本中筛选DE-MGs;2)基于ConsensusClusterPlus的分子分型;3)采用LASSO回归和十折交叉验证构建预测模型;4)利用单细胞转录组(4487个细胞)和CellChat分析细胞通讯网络。
分子亚型鉴定揭示临床异质性
通过16个DE-MGs的表达谱将IRI患者分为C1/C2亚型。C1组呈现补体激活、IL-6-JAK-STAT3信号通路上调,伴随巨噬细胞、肥大细胞等显著浸润,DGF发生率高达41.7%(p<0.001),且多为循环死亡供体(Donation after circulatory death, DCD)来源。而C2组以脂肪酸代谢、氧化磷酸化为特征,DGF仅14.3%。
预测模型建立与验证
DGF预测模型包含5个基因:促凋亡基因DDIT3(DNA damage inducible transcript 3)、抗凋亡基因MCL1(Myeloid cell leukemia 1)、应激响应基因PPP1R15A(Protein phosphatase 1 regulatory subunit 15A)及炎症相关基因ANXA1/HSPA1B。长期存活模型则整合了ANXA1、分子伴侣DNAJA1(DnaJ heat shock protein family member A1)、转录因子JUN和G蛋白调节子RGS2(Regulator of G protein signaling 2)。
肥大细胞的核心作用
单细胞分析发现DE-MGs在肥大细胞特异性高表达。细胞互作网络显示,高表达DE-MGs的肥大细胞亚群通过分泌AREG(Amphiregulin)、CSF1(Colony stimulating factor 1)等配体,激活PT细胞(Proximal tubule)的EGFR(Epidermal growth factor receptor)和单核细胞的CSF1R(Colony stimulating factor 1 receptor),形成促纤维化微环境。
这项研究开创性地将线粒体分子特征与移植临床结局预测相结合,其重要意义在于:1)提供可解释的生物标志物组合,DGF预测模型AUC优于传统临床指标;2)揭示肥大细胞通过AREG-EGFR等通路驱动移植肾损伤的新机制;3)为开发针对线粒体功能障碍的干预策略(如MCL1抑制剂)提供理论依据。未来可通过前瞻性队列验证模型的临床应用价值,并探索靶向肥大细胞-肾小管上皮细胞互作的精准治疗策略。
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