转录因子系统性激活重构成纤维细胞状态图谱揭示炎症调控新靶点

【字体: 时间:2025年08月07日 来源:Nature Genetics 29

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  来自国际顶尖团队的研究人员通过CRISPR激活(CRISPRa) Perturb-seq技术平台,系统性激活1,836个人类转录因子,成功在体外重构成纤维细胞关键转录状态,鉴定出KLF2/4调控的通用状态和PLAGL1介导的炎症状态,为炎症性疾病治疗提供新靶点。

  

细胞图谱计划揭示常见细胞类型往往包含独特的、反复出现的转录状态,但这些状态的功能调控机制仍是未解之谜。最新研究突破性地证明,通过系统性激活转录因子(TFs)可在体外重现这些状态,为机制和功能研究提供理想模型。

研究者构建了可扩展的CRISPR激活(CRISPRa) Perturb-seq平台,在两种细胞类型中激活1,836个转录因子。实验显示CRISPRa诱导的基因表达处于生理范围内,且染色质特征可预测细胞响应性。通过与图谱数据比对发现,转录因子扰动成功重现了成纤维细胞关键状态:KLF2和KLF4调控的"通用状态"广泛存在于多种组织,而PLAGL1则主导疾病相关的炎症状态。更令人振奋的是,诱导通用状态可抑制炎症状态,这一发现为炎症性疾病治疗带来新思路。

该研究不仅确立了CRISPRa作为分化细胞精准扰动的新工具,更开创了离体研究临床相关转录状态的普适性策略。表观遗传特征预测模型的建立,以及KLF/PLAGL1调控通路的解析,为理解细胞状态转换提供了全新框架。

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