综述:依赖解旋酶的等温扩增技术将生物传感技术发展为现代诊断工具

《Microchemical Journal》:Helicase-dependent isothermal amplification turns biosensing into modern diagnostic technologies

【字体: 时间:2025年08月07日 来源:Microchemical Journal 5.1

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  HDA是无需温度循环的等温核酸扩增技术,利用DNA解旋酶高效扩增靶序列,适用于POC和资源有限地区,具有成本低、操作简便优势,但存在长片段扩增效率低、酶稳定性不足等问题,未来需优化酶体系及检测方法。

  HDA,即依赖解旋酶的等温扩增技术,是一种无需温度循环的DNA扩增方法。这项技术通过解旋酶的酶活性将双链DNA解开,从而实现特定目标序列的扩增。HDA在分子诊断中的应用潜力巨大,尤其是在资源有限的环境中,它提供了快速、便携和经济的检测手段。随着技术的不断进步,HDA正在逐步成为传统PCR技术的有效替代方案,特别是在现场诊断和即时检测(point-of-care, POC)领域。

HDA技术的核心在于其模拟生物体内DNA复制过程的能力。与传统的PCR相比,HDA无需复杂的温度控制设备,仅需恒定温度即可完成扩增。这种特性使得HDA在一些特殊场景中具有明显优势,例如在野外或资源匮乏地区进行病原体检测。此外,HDA还可以用于RNA的扩增,通过加入耐热的逆转录酶,实现从RNA模板合成互补DNA(cDNA),随后进行扩增。这一过程称为RT-HDA,能够在短时间内完成对RNA的高灵敏度扩增,为病原体快速检测提供了新的可能性。

尽管HDA技术具有诸多优点,但其在实际应用中仍面临一些挑战。首先,HDA的扩增效率相对较低,尤其是在扩增较长片段时,受限于解旋酶的进程性。为了解决这一问题,科学家们开发了一种名为helimerase的双功能蛋白,将UvrD解旋酶与Bst-DNA聚合酶结合,从而提高了扩增效率,使得能够扩增长达2.3千碱基的DNA片段。然而,这种改良的helimerase尚未实现商业化,因此在实际应用中仍存在一定局限。

其次,HDA技术的酶稳定性较差,与PCR所使用的耐热酶相比,HDA所依赖的解旋酶和聚合酶在储存和运输过程中更容易降解。这不仅影响了检测的可靠性,也限制了其在需要长时间储存或运输的环境中的应用。此外,HDA在较低温度下的扩增过程中容易发生非特异性扩增,导致假阳性结果。这种非特异性扩增通常是由引物二聚体形成引起的,尤其是在处理低浓度目标核酸或复杂样本时更为明显。因此,提高引物设计的特异性以及优化反应条件是进一步提升HDA性能的关键。

为了克服这些挑战,近年来研究人员对HDA进行了多项改进。例如,通过蛋白质工程手段开发出了一种改良的PcrA M6解旋酶,该酶具有更快的解旋速度和更高的进程性。结合单链DNA结合蛋白(SSB)和标准PCR试剂,这种改进后的技术被称为SHARP(SSB-Helicase Assisted Rapid PCR)。SHARP能够在较短时间内完成对长达6000碱基的DNA片段的扩增,同时减少非特异性产物的生成,显著提高了检测的效率和准确性。

除了技术改进,HDA的检测方法也在不断优化。传统的终点检测方法通常需要复杂的设备,而HDA结合了多种先进的检测手段,如电化学检测、磁性粒子检测和荧光检测等。这些方法能够提高检测的灵敏度和特异性,使得HDA在病原体检测、遗传分析和环境监测等多个领域展现出广泛的应用前景。例如,HDA已被成功应用于多种病原体的检测,包括淋球菌、艰难梭菌、沙眼衣原体、结核分枝杆菌以及人乳头瘤病毒(HPV)的某些亚型。这些应用表明,HDA在实际操作中具有较高的可行性。

在实际应用中,HDA的便携性和操作简便性使其成为现场诊断的理想选择。特别是在突发公共卫生事件中,如病毒爆发或疫情监测,HDA能够提供快速、可靠的检测结果,帮助医疗人员及时采取应对措施。此外,HDA还可以与微流控技术、智能手机读数系统和自动化样本处理设备相结合,进一步提升其在诊断中的实用性。这些技术的整合不仅能够提高检测的效率,还能降低对专业实验室的依赖,使得诊断能够在更广泛的环境中进行。

然而,HDA的广泛应用仍受到一些因素的限制。首先,HDA的商业化程度相对较低,许多技术仍然处于实验室研究阶段。其次,HDA的成本较高,尤其是在需要高纯度酶和复杂试剂的情况下。相比之下,其他等温扩增技术如LAMP和RPA已经实现了更广泛的商业化,并在多个领域得到了实际应用。此外,HDA的检测灵敏度和特异性仍有待进一步提升,尤其是在处理复杂样本或低浓度目标核酸时。

为了推动HDA技术的发展,未来的研究方向应集中在以下几个方面:一是提高酶的稳定性,使其能够在更广泛的环境条件下保持活性;二是优化引物设计,减少非特异性扩增的可能性;三是开发更高效的检测方法,提高检测的灵敏度和特异性;四是探索HDA在多目标检测中的应用,实现对多种病原体或遗传变异的同时检测。此外,HDA还需要在成本控制、设备小型化和操作简便性方面进行改进,以满足资源有限地区的需求。

综上所述,HDA作为一种等温扩增技术,凭借其简单、快速和低成本的特点,在分子诊断领域展现出巨大的潜力。尽管目前仍面临一些挑战,但随着技术的不断进步和创新,HDA有望成为一种更加成熟和实用的诊断工具。特别是在应对全球性健康威胁和推动医疗公平性方面,HDA的进一步发展将为人类健康带来深远的影响。
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