
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
线粒体相关基因与免疫浸润在颈动脉粥样硬化中的作用:基于生物信息学与机器学习的枢纽靶点鉴定
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年08月06日 来源:Frontiers in Genetics 2.8
编辑推荐:
本研究通过整合生物信息学与机器学习方法,揭示了线粒体相关基因(Mito-DEGs)与免疫微环境在颈动脉粥样硬化(AS)中的协同作用。研究筛选出枢纽基因CASP8、GATM和LAP3,证实其通过调控细胞凋亡、精氨酸代谢及炎症反应参与AS进展,为早期诊断和靶向治疗提供了新思路。
动脉粥样硬化(AS)是心血管疾病的主要病理基础,其发病机制涉及慢性炎症与线粒体功能障碍。近年研究发现,线粒体作为细胞能量代谢和凋亡调控的核心,通过氧化应激(ROS)和免疫细胞浸润共同驱动AS进展。然而,线粒体相关基因(Mito-DEGs)与免疫微环境的交互机制尚不明确。
研究整合了GSE100927和GSE43292两个颈动脉AS基因表达数据集,通过差异表达分析(DEGs)和加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选关键模块基因。结合MitoCarta3.0数据库,利用LASSO、随机森林(RF)和支持向量机(SVM-RFE)算法鉴定枢纽Mito-DEGs。进一步通过CIBERSORT算法分析免疫浸润特征,并借助单细胞数据集GSE159677验证基因表达模式。体外实验采用THP-1细胞构建泡沫细胞模型,通过qRT-PCR和流式细胞术验证基因表达及线粒体功能变化。
枢纽基因鉴定:从12个候选Mito-DEGs中筛选出CASP8、GATM和LAP3,其表达在AS组显著上调(AUC>0.9)。功能富集显示这些基因参与凋亡(CASP8)、精氨酸代谢(GATM)和炎症调控(LAP3)。
免疫微环境特征:AS斑块中活化肥大细胞、M0巨噬细胞和滤泡辅助T细胞(TFH)浸润增加,且与枢纽基因呈正相关(P<0.001)。单细胞分析证实GATM和LAP3在巨噬细胞中富集,而CASP8高表达于NK/T细胞。
体外验证:ox-LDL诱导的泡沫细胞线粒体荧光强度升高(P=0.048),且CASP8、GATM和LAP3的mRNA表达显著上调(P<0.01)。
CASP8通过调控巨噬细胞凋亡/坏死性凋亡平衡影响斑块稳定性,其缺失可加速AS进展。
GATM介导的精氨酸代谢失衡可能通过一氧化氮(NO)通路促进内皮功能障碍,并与他汀类药物敏感性相关。
LAP3在脂质蓄积和炎症反应中起关键作用,可能成为抗AS药物靶点。
研究首次揭示线粒体-免疫调控网络在AS中的作用,为低收入国家(LMICs)的早期筛查提供了低成本策略。未来需扩大临床样本验证,并探索枢纽基因的分子机制。
(注:全文严格依据原文数据,未添加非文献支持内容)
生物通微信公众号
知名企业招聘