基于CRISPR-RfxCas13d系统的外显子跳跃异构体功能筛选揭示结直肠癌新靶点

【字体: 时间:2025年08月05日 来源:Cell Systems 7.7

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  来自Sun团队的研究人员利用CRISPR-RfxCas13d系统开发了靶向外显子-外显子连接区的转录组特异性沉默平台,通过全转录组gRNA文库筛选出3,744个人类ES事件,发现HMGN3 Δ6等关键外显子跳跃异构体可促进结直肠癌(CRC)细胞增殖,为癌症治疗提供了新靶点。

  

这项突破性研究构建了基于CRISPR-RfxCas13d系统的创新平台,专门用于靶向沉默外显子跳跃(Exon Skipping, ES)产生的特殊转录本。研究人员巧妙设计了靶向外显子连接区的向导RNA(gRNA),建立覆盖3744个ES事件的转录组规模文库,在结直肠癌(CRC)细胞系中开展体内外功能性筛选。

令人振奋的是,该研究首次揭示外显子6跳跃产生的HMGN3 Δ6异构体具有显著促癌效应,能强力驱动肿瘤细胞增殖。通过严谨的功能验证,证实该异构体对CRC进展具有关键作用。这项成果不仅证实CRISPR-RfxCas13d在异构体特异性功能基因组学研究中的强大潜力,更发现了一个由ES驱动的重要肿瘤生物学新机制。

特别值得注意的是,研究发现的ES事件与患者预后和分子亚型显著相关,为癌症精准治疗提供了全新视角。这些突破性发现将ES衍生转录本定位为极具前景的癌症治疗靶点,为开发创新抗癌策略开辟了新途径。

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