自适应学习物理辅助光场显微镜实现亚细胞动态的长时程毫秒级超分辨率三维成像

【字体: 时间:2025年08月05日 来源:Nature Communications 15.7

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  本研究针对传统超分辨率显微镜在活细胞长时程三维成像中面临的光毒性和扫描速度限制,开发了自适应学习物理辅助光场显微镜(Alpha-LFM)。通过物理辅助深度学习框架和自适应调谐策略,实现了120 nm空间分辨率和每秒数百体积的成像速度,成功捕捉了溶酶体-线粒体相互作用、过氧化物酶体快速运动等亚细胞动态,并完成了60小时连续观测。该技术突破了现有显微镜在速度、分辨率和光效率之间的"不可能三角"限制,为细胞生物学研究提供了革命性工具。

  

在生命科学研究中,长时间、高时空分辨率的三维活细胞成像一直是未解的难题。传统超分辨率显微镜如结构光照明显微镜(3D SIM)和光片显微镜(LSM)虽然能突破衍射极限,但受限于需要数百帧扫描重建,时间分辨率仅达秒级,且光毒性限制了长时程观察。而新兴的光场显微镜(LFM)虽能通过单次快照实现三维捕获,却因像素采样不足和数值孔径限制,分辨率难以满足亚细胞结构研究需求。这种"速度-分辨率-光子效率"的不可兼得困境,严重制约了细胞器相互作用等快速动态过程的深入研究。

针对这一挑战,华中科技大学武汉光电国家研究中心的Lanxin Zhu、Jiahao Sun等研究人员在《Nature Communications》发表了一项突破性研究。他们开发的自适应学习物理辅助光场显微镜(Alpha-LFM)通过创新的物理辅助深度学习框架,将光场成像的空间分辨率提升至120 nm,同时保持毫秒级时间分辨率和低光毒性,实现了活细胞亚细胞动态的超分辨率四维成像。

研究团队采用了三项关键技术:1)建立物理辅助分层数据合成流程,从相同3D超分辨率数据生成多阶段训练数据;2)设计包含去噪、去混叠和三维重建子网络的自适应学习网络框架(Alpha-Net);3)开发分解渐进优化(DPO)策略实现多阶段网络的协同训练。对于未见样本,系统可通过原位宽场图像快速调谐预训练模型,实现对新结构的自适应重建。

分辨率与结构保真度

通过综合性能金字塔(NCPP)评估显示,Alpha-Net在分辨率和保真度上显著优于传统端到端VCD网络。对Argolight分辨率板的成像证实其可分辨120 nm线对,接近Airyscan显微镜的基准分辨率。在固定U2OS细胞中,Alpha-Net对溶酶体的重建保真度(SSIM=0.92)远超LFD、VS-LFD等方法,且实现了接近各向同性的120 nm分辨率。

与其他方法的比较性能

Alpha-LFM在220×220×10 μm3视野内实现了333 Hz的体积成像速率。与VS-LFD和VCD相比,其重建结果能清晰显示线粒体外膜等精细结构。低曝光下的稳定去噪能力使其在40,000次成像后仍保持50%以下光漂白,显著优于LSFM、Airyscan和3D SIM。

过氧化物酶体和内质网的高速三维成像

借助100体积/秒的成像速度,系统成功捕捉到过氧化物酶体(SKL-mApple标记)高达10 μm/s的运动速度,这是10体积/秒采样所无法发现的。对内质网(Sec61β-EGFP标记)的观测则首次在毫秒尺度揭示了ER小管重构的动态过程,如40 ms内新ER小管的形成。

溶酶体-线粒体相互作用的成像分析

双色成像显示,3D分析发现的溶酶体-线粒体(Lyso-Mito)接触率(48%)显著低于2D投影的71%,纠正了24%的误判。速度分析表明,溶酶体接触使线粒体分裂和融合速度分别提高至1.35±0.21 μm/min和1.62±0.28 μm/min(P<0.05)。

跨细胞周期的线粒体命运长时程成像

通过自主设计的自动成像策略,系统实现了60小时连续观测,追踪了线粒体(Cox4-EGFP标记)在完整细胞周期中的演变。数据显示,G2期线粒体的"无事件"比例(80.7%)显著低于G1期(92%),反映了细胞分裂前的线粒体活跃状态。

这项研究通过物理模型引导的深度学习策略,成功突破了传统显微镜在速度、分辨率和光效率之间的根本性限制。Alpha-LFM提供的120 nm各向同性分辨率、毫秒级时间分辨率和长达60小时的成像能力,使研究人员首次能够在生理条件下全面观察亚细胞器的快速相互作用和长期演化。特别值得注意的是,该系统对溶酶体-线粒体相互作用的三维量化纠正了传统二维分析的显著误差,揭示了细胞器接触对线粒体动力学的影响。这些突破不仅为细胞生物学研究提供了全新工具,其物理辅助的网络设计思路也为其他显微成像技术的开发提供了重要借鉴。未来通过与自适应光学或双光子激发等技术的结合,有望进一步推动在体亚细胞动态观测的发展。

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