长距离扩散解释印度半岛特有石龙子当代分布格局的成因

这篇研究通过多基因位点系统发育分析（ML和BI）、分歧时间估算及生物地理学分析，揭示了印度西南部特有石龙子Sphenomorphus dussumieri与巽他地区物种的姐妹关系，提出其祖先种群在低海平面时期通过跨洋扩散（transoceanic dispersal）从巽他陆架迁徙至印度半岛的假说，为理解东南亚-印度生物地理格局提供了关键案例。研究采用线粒体（12S rRNA/16S rRNA/ND2/ND4）和核基因（R35/NGFB）标记，结合SH检验否定了传统"印度大陆连续分布后隔离分化"假说。

　　

地质背景与科学问题

印度板块与欧亚板块约5000万年前（50 Mya）的碰撞引发喜马拉雅造山运动，形成东北印度复杂地形与生态系统。而印度半岛自6600万年前（66 Mya）德干玄武岩喷发后保持相对稳定，这种地质差异造就了印度次大陆生物分布的割裂格局。石龙子属（Sphenomorphus）作为热带亚洲分布最广的蜥蜴类群之一，在印度呈现典型间断分布：4个物种集中于东北印度，唯独Sphenomorphus dussumieri孤立分布于西南喀拉拉邦低海拔地区。这种奇特分布引发核心科学问题：是大陆连续分布后的隔离分化（vicariance），还是独立扩散事件导致？

研究方法与技术路线

研究团队在2022-2023年采集喀拉拉邦两个地理种群（Thattekad鸟类保护区和Sabarimala山麓）的S. dussumieri标本，采用Qiagen试剂盒提取DNA，扩增4个线粒体标记（12S rRNA/16S rRNA/ND2/ND4）和2个核基因（R35/NGFB），总长3931bp。通过MUSCLE比对序列后，采用PartitionFinder 2.1确定最佳分区方案，分别进行最大似然法（ML，IQ-TREE）和贝叶斯推断（BI，MrBayes 3.2）系统发育重建。为验证假说，特别实施SH检验比较约束树（强制印度物种单系群）与非约束树的拟合优度。

关键发现与验证

系统发育树显示S. dussumieri以98% UFBS支持度与巽他地区物种构成姐妹群，该支系又与印支支系（100% UFBS）形成姊妹关系。SH检验显著支持非约束树（ΔlnL=38.72，p<0.001），否定了印度物种单系起源假说。分歧时间估算表明其祖先约在中新世（23.5-19.2 Mya）通过跨洋扩散抵达印度半岛，此时全球海平面较低（较现今低约120米），巽他陆架大面积出露，可能通过岛屿跳板（island-hopping）完成扩散。

生物地理学意义

研究首次证实印度半岛石龙子属于巽他生物区系成分，而非东北印度物种的近缘类群。这一发现为理解东南亚-印度生物交流提供了新视角：1）不同于东北印度通过陆桥与东南亚连接的"生物走廊"模式；2）半岛物种可能通过海洋扩散建立种群，类似壁虎科（Gekkonidae）的跨洋扩散案例。研究还提示晚新生代海平面波动对热带生物分布的关键影响，为岛屿生物地理学理论提供了新的实证案例。

方法学创新与局限

研究创新性整合多基因位点、拓扑检验与模型比较：1）采用b-ModelTest自动选择最佳替代模型；2）在BioGeoBEARS中设置2000km距离阈值（参考石龙子跨大西洋扩散记录）优化扩散概率参数。但存在样本量有限（2个地理种群）和巽他支系支持度中等（85% UFBS）的局限，未来需增加采样和基因组数据验证。