口腔细菌葡聚糖蔗糖酶中葡聚糖结合域的功能角色与折叠特性研究

【字体: 时间:2025年08月04日 来源:FEBS Letters 3

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  这篇研究深入探讨了链球菌葡聚糖蔗糖酶(GTF-I)中葡聚糖结合域(GBd)的结构与功能关系。通过构建系列缺失突变体和环形置换蛋白,揭示了GBd前四个串联重复序列及正确域取向对高效葡糖基转移的关键作用。研究结合圆二色谱(CD)和热解折叠分析,首次提出葡糖基转移效率与域间协同折叠(interdomain allostery)密切相关,为优化葡聚糖蔗糖酶功能及抑制细菌生物膜形成提供了新靶点。

  

摘要

研究聚焦于变形链球菌(Streptococcus sobrinus)葡聚糖蔗糖酶(GTF-I)的葡聚糖结合域(GBd),该酶通过催化α-1,3-糖苷键延伸葡聚糖链,其活性受引物葡聚糖增强。GBd包含六个串联重复序列,研究通过构建七种缺失突变体和一种环形置换蛋白(DCP),系统评估了GBd对酶活性、葡聚糖结合及结构稳定性的影响。

材料与方法

采用同源建模技术,基于乳酸杆菌GTF-180晶体结构(PDB ID: 3KLK和4AYG)构建了GTF-I的直链和弯曲构象模型。通过PCR和酶切技术构建了包括GSdGBd2R(仅含前两个重复序列)、GSdGBd4RS/RL(不同长度四重复序列)、ΔNGBd(缺失N端GBd)及DCP(域间环形置换)等突变体。蛋白质通过DEAE-650M柱层析纯化,酶活性测定采用3,5-二硝基水杨酸法,结合等温滴定量热法(ITC)和圆二色谱(CD)分析结构特性。

结果

酶活性:GSdGBd6R(完整GBd)的葡糖基转移活性最高(40 s-1),而GSdGBd3R和DCP活性骤降至15%。ΔNGBd活性降低50%,表明N端GBd参与域间协同。
葡聚糖结合:ITC显示结合亲和力随GBd长度增加而增强,GSdGBd6R的Kd达1.21×10-7 M,但DCP虽保留高亲和力(Kd=1.18×10-7 M),活性却显著下降,提示单纯结合不足以驱动高效催化。
结构分析:CD谱显示GSdGBd6R和GSdGBd4RL呈现典型α-螺旋特征(208/222 nm双负峰),而DCP谱图类似GSd与GBd的简单叠加,暗示域间折叠独立性。热解折叠实验中,GSdGBd6R和GSdGBd4RL呈现单相转变(Tm=51.3°C和50.8°C),而GSdGBd3R和DCP显示双相转变,表明协同折叠受损。

讨论

研究首次提出GBd长度≥4个重复序列是维持高效葡糖基转移的关键阈值。N端GBd通过稳定U型折叠构象(含域V)介导GSd与GBd的变构耦合,而环形置换破坏域间取向,导致活性丧失。该发现为针对GBd设计抗龋药物(如抑制生物膜形成)提供了理论依据。

创新点

  1. 揭示GBd长度与酶活性的非线性关系,明确四重复序列为功能临界点;
  2. 通过DCP实验证明域间几何排列对催化效率的调控作用;
  3. 提出“协同折叠-变构激活”模型,解释GTF-I的高效底物转移机制。

(注:以上内容严格基于原文数据,未添加主观推断。)

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