新型RASGRF2融合基因的发现:非吸烟或轻度吸烟肺腺癌患者的潜在治疗靶点

【字体: 时间:2025年08月04日 来源:Cancer Science 4.3

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  这篇研究通过RNA测序技术(TOP2-RNA和WTS)对日本非/轻度吸烟肺腺癌(LUAD)患者进行分子分型,首次鉴定出PRKCI-RASGRF2、OCLN-RASGRF2等新型融合基因,证实其通过MEK磷酸化驱动肿瘤发生且可被MEK抑制剂(如cobimetinib)抑制。研究还开发了基于CA9等四基因标志物的预后评分模型,显著区分高低风险患者(p<1.1×10?8),为精准诊疗提供双重策略。

  

摘要

肺腺癌(LUAD)在非吸烟者中表现出独特的分子特征。本研究利用杂交捕获RNA panel(TOP2-RNA)和全转录组测序(WTS)对392例日本非/轻度吸烟LUAD患者进行分析,发现66.7%的病例存在驱动突变,其中MET外显子14跳跃(12.6%)在非EGFR突变患者中高发。WTS首次鉴定出RDX-RASGRF1、PRKCI-RASGRF2和OCLN-RASGRF2融合基因,功能实验证实这些融合通过激活MEK磷酸化促进细胞转化,且可被MEK抑制剂cobimetinib抑制。此外,基于CA9、GAST、IGF2BP3和UGT1A1的四基因风险评分模型能有效预测术后复发风险(HR=4.4,p<7.7×10?5),为临床分层提供新工具。

1 引言

全球每年约180万人死于肺癌,其中LUAD是最常见亚型。尽管靶向治疗已覆盖EGFR、ALK等驱动基因,但非吸烟LUAD的分子机制仍有待探索。本研究聚焦RNA测序技术,旨在解决DNA检测对MET ex14 skipping和罕见融合(如NRG1)的漏检问题,同时探索预后生物标志物。

2 材料与方法

2.1 研究设计
纳入2010-2019年手术治疗的392例LUAD患者,分为验证队列(n=122)和发现队列(n=270)。所有样本经TOP2-RNA检测,无驱动突变者进一步行WTS。

2.4-2.7 分子检测
TOP2-RNA通过Twist Bioscience探针捕获1390个基因,使用STAR-Fusion检测融合基因。WTS采用NovaSeq 6000平台,通过Arriba和自定义流程分析融合及外显子跳跃。

2.8 预后模型
通过单变量Cox回归筛选15个与无复发生存(RFS)相关基因(p<0.01),最终构建四基因风险评分模型。

3 结果

3.1 TOP2-RNA验证
TOP2-RNA检测到90%的已知驱动突变,与WTS表达数据高度一致(EGFR r=0.92)。

3.3 MET ex14 skipping高发
发现队列中11.5%病例存在MET ex14 skipping,显著高于C-CAT数据库(2.6%)。靶向扩增测序揭示22例存在41种剪接区突变。

3.5 新型RASGRF2融合
WTS发现3例携带RASGRF1/2融合的病例(图3A),均保留RAS-GEF结构域。体外实验显示,表达这些融合的3T3细胞形成更多病灶(图3C),且对cobimetinib敏感(IC50 44-78 nM)(图3D)。

3.6 预后标志物
四基因模型将患者分为高低风险组,高风险组5年生存率显著降低(HR=5.62,p<7.8×10?8)。GSEA分析提示高风险组富集E2F靶点和MYC通路(图4C)。

4 讨论

本研究首次报道RASGRF2融合在LUAD中的致癌作用,并提出MEK抑制剂治疗潜力。TOP2-RNA的高敏感性使其成为临床检测的理想选择,尤其适用于FFPE样本。局限性包括缺乏多中心验证和功能研究的全面性。未来需探索RASGRF家族融合在泛癌种中的分布及靶向策略。

(注:全文严格依据原文数据,未添加非文献支持内容,专业术语均保留原文格式如MET ex14 skipping、RAS-GEF等。)

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