基于化学信息学的SERS纳米传感器分子受体推荐系统:XGBoost框架驱动的多受体优化策略

【字体: 时间:2025年08月03日 来源:Nature Communications 15.7

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  本研究针对表面增强拉曼散射(SERS)检测中分子受体选择依赖人工试错、效率低下的问题,开发了一种基于XGBoost算法的三阶段"识别-排序-推荐"框架。通过建立包含9种受体与卤代苯甲醚相互作用的SERS数据库,结合密度泛函理论(DFT)验证,该系统能智能推荐最优受体组合,对结构类似物的区分准确率达95%以上。创新性地采用协同过滤技术,仅凭分子结构即可预测未测试分子的最佳受体组合,为复杂传感应用提供了从经验探索到数据驱动方法的重要范式转变。

  

在环境监测和食品安全领域,卤代苯甲醚类化合物的检测至关重要。这类结构相似的化合物因氯取代基数量和位置差异而具有不同毒性,传统检测方法面临特异性不足的挑战。表面增强拉曼散射(SERS)技术虽能提供分子指纹信息,但其性能高度依赖分子受体的选择。目前受体筛选仍采用耗时费力的试错法,且受体数量过多会导致"维度灾难"(CoD),严重影响机器学习模型的准确性。如何智能优化受体组合,成为提升SERS检测效能的关键科学问题。

新加坡国立大学的研究团队在《Nature Communications》发表创新成果,开发了首个化学信息学指导的SERS受体推荐系统(RS)。该系统通过建立包含9种硫醇化受体与5种卤代苯甲醚相互作用的SERS数据库,结合密度泛函理论(DFT)计算验证,构建了基于XGBoost算法的三阶段框架。研究突破性地实现了对结构类似物>95%的区分准确率,并首次实现仅凭分子结构预测未测试分子最佳受体组合的能力。

研究采用三项关键技术:1) 银纳米立方体的可控合成与九种受体功能化修饰;2) 结合DFT计算阐明受体-分析物相互作用机制;3) 开发包含特征选择、重要性排序和协同过滤的机器学习框架。通过系统采集1620组SERS光谱,建立首个受体-卤代苯甲醚相互作用数据库。

研究结果部分,"阐明受体-卤代苯甲醚相互作用"显示,DFT计算揭示了CHO受体通过双齿偶极相互作用与卤代苯甲醚形成能量-28.0至-17.0 kJ/mol的复合物,其结合构型与SERS光谱变化(如vCO伸缩振动1724 cm-1的蓝移)高度吻合。

"RS阶段1:识别单个受体特征组"证实,XGBoost算法自动筛选的14个特征组(对应CHO受体的特定振动模式)使分类准确率从70.9%提升至72.8%,有效缓解维度灾难。

"RS阶段2-3:排序特征组并推荐多受体"揭示,六受体组合(CHO-NH2-OH-Br-COOH-PY)达到96.6%的峰值准确率,而更多受体反而因数据冗余降低性能,证实了算法的优化能力。

"建立卤代苯甲醚RS数据库"部分构建了包含26种分类组合的数据库,显示CHO受体在21种组合中表现最优,与DFT计算的结合能趋势一致。

"数据驱动协同过滤推荐未测试分子受体"的创新性体现在,仅凭2,4,6-TBA的分子结构(Tanimoto相似度36.27%),系统推荐的六受体组合与后续实验验证结果完全一致,准确率达95.7%。

这项研究实现了三大突破:首先,将电子商务领域的推荐系统概念创新性地引入化学传感,建立了首个数据驱动的受体优化框架;其次,通过特征重要性分析与DFT计算的相互验证,增强了机器学习模型的可解释性;最后,开发的协同过滤方法实现了"先预测后实验"的新范式。该技术对环境污染监测、食品安全检测等需要区分结构类似物的领域具有重要应用价值,为开发下一代智能纳米传感器提供了方法论指导。研究展现的"化学信息学+机器学习"融合策略,为材料科学领域的理性设计开辟了新途径。

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