DNA盒辅助T7转录联合Cas13a检测甲型H1N1流感病毒的生物传感新策略

【字体: 时间:2025年08月03日 来源:Enzyme and Microbial Technology 3.7

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  (编辑推荐)本研究创新性地将六面体DNA盒(DNA box)与分裂T7启动子转录技术结合,构建了Db-T7(S)纳米机器,通过CRISPR/Cas13a系统实现H1N1病毒RNA的fM级灵敏检测。该技术显著提升了反应速率和生物稳定性,为呼吸道传染病监测提供了新型分子诊断工具。

  

亮点

• DNA盒纳米结构为分裂T7转录提供稳定载体

• 四组机械臂设计实现目标RNA高效捕获

• Cas13a反式切割活性实现信号级联放大

• 检测限低至飞摩尔(fM)水平

材料与方法

实验采用上海生工合成的寡核苷酸(序列见表S1),T7 RNA聚合酶(NEB公司)及 Monarch RNA纯化试剂盒。DNA盒通过八条单链边界域固定分裂T7启动子机械臂(ST1/ST2),在37℃等温条件下完成目标RNA的捕获-组装-转录级联反应。

DNA盒生物传感机制

如图1所示,DNA盒边缘的八个单链域特异性结合带有分裂T7启动子的DNA机械臂,形成四组可编程的"抓取装置"。当目标H1N1 RNA存在时,机械臂通过toehold介导的链置换反应重构完整T7启动子,驱动T7 RNA聚合酶大量转录ssRNA。这些转录产物激活Cas13a的"反式切割"(trans-cleavage)活性,切割报告分子释放荧光信号。

结论

相较于SHERLOCK等主流CRISPR检测平台(对比见表S4),本系统在灵敏度(达fM级)方面表现相当,但在检测时间上仍需优化。DNA盒的刚性结构有效抵抗核酸酶降解,其三维空间识别能力弥补了CRISPR技术的维度局限,为复杂生物样本中的病毒监测提供新思路。

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