线粒体相关基因SLC2A1与IFI27作为急性呼吸窘迫综合征新型诊断标志物的鉴定及机制研究

【字体: 时间:2025年08月03日 来源:Scientific Reports 3.9

编辑推荐:

  本研究针对急性呼吸窘迫综合征(ARDS)诊断延迟和治疗靶点缺乏的临床难题,通过整合单细胞测序(scRNA-Seq)和转录组学分析,首次鉴定出线粒体相关基因SLC2A1和IFI27作为ARDS的新型诊断标志物。研究人员发现CD14+单核细胞亚群中这两个基因的异常表达与线粒体功能障碍密切相关,为ARDS的早期诊断和靶向治疗提供了理论依据。

  

急性呼吸窘迫综合征(ARDS)作为一种致死率高达35%-45%的危重症,其核心病理特征是肺泡上皮和血管内皮损伤导致的非心源性肺水肿。尽管机械通气和抗炎治疗是当前主要手段,但临床仍面临诊断延迟、特异性治疗缺乏等挑战。线粒体作为细胞能量工厂和氧化应激主要来源,其功能障碍已被证实与ARDS进展密切相关,然而具体分子机制和诊断标志物尚未明确。

广西医科大学第二附属医院的研究团队通过多组学联合分析,在《Scientific Reports》发表了突破性研究成果。该研究首先从GEO数据库获取ARDS患者外周血单核细胞(PBMC)的转录组和单细胞测序数据,运用limma差异分析筛选出343个差异表达基因(DEGs),与线粒体相关基因(MRGs)取交集获得20个关键基因。通过LASSO回归和人工神经网络(ANN)建模,最终锁定SLC2A1(葡萄糖转运蛋白1)和干扰素诱导蛋白IFI27作为核心标志物。技术路线涵盖差异表达分析、单细胞聚类(UMAP降维)、基因集富集分析(GSEA)、细胞通讯网络构建等前沿方法,并采用qRT-PCR在临床样本中验证标志物表达。

研究结果揭示:

  1. 线粒体相关差异基因的鉴定:通过GSE32707数据集分析发现ARDS患者存在41个上调和302个下调基因,其中20个与线粒体功能相关,主要富集于线粒体内膜组装(GO:0005743)和HIF-1信号通路等。

  2. 单细胞图谱解析:对24,102个PBMC进行聚类,鉴定出单核细胞(Mono)、T细胞等6种免疫细胞,其中CD14+和CD16+单核细胞亚群在ARDS中呈现显著差异。

  3. 标志物功能机制:SLC2A1通过调节糖代谢促进炎症反应,而IFI27可能通过干扰素信号通路影响线粒体能量代谢。两者在CD14+单核细胞中的共表达提示其协同作用。

  4. 临床验证:qRT-PCR证实脓毒症患者外周血中SLC2A1和IFI27 mRNA水平显著高于健康对照,与生物信息学预测一致。

这项研究的创新性在于首次建立线粒体功能障碍与ARDS免疫微环境的直接联系:CD14+单核细胞中SLC2A1/IFI27的异常表达不仅导致糖酵解重编程和氧化应激加剧,还通过改变细胞周期分布(G2/M期比例升高)促进炎症扩散。研究者预测的hsa-miR-148a-3p等调控网络及靶向药物(如phloretin)为开发ARDS的精准诊疗策略提供了新方向。该成果对理解ARDS的分子机制具有重要理论价值,其基于外周血标志物的无创诊断方案更具临床转化潜力。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号