太赫兹驱动可控分子异构化:精准调控生物分子构象的新策略

【字体: 时间:2025年08月02日 来源:Nature Communications 15.7

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  研究团队通过分子动力学模拟揭示了太赫兹(THz)光可驱动视网膜衍生物(rwSb)中σ键的定向旋转异构化,实现了频率特异性、非侵入且可逆的分子构象调控。该研究为精准操纵生物分子构象(如视黄醛异构体转换)提供了新方法,对药理学和生物化学领域具有重要应用价值。

  

在生命科学领域,分子构象变化如同生物活动的"密码开关",从蛋白质折叠到信号传导,都依赖于化学键的异构化。然而,传统调控方法如温度改变或化学修饰往往缺乏精准性,且可能破坏复杂的生物系统。尤其对于σ键(单键)旋转引发的异构化,其能量壁垒虽低于π键(双键),但热运动驱动的随机性使得精确控制成为难题。这一挑战在视觉光感受器视紫红质中尤为突出——其11-顺式视黄醛(11-cis retinal)向全反式异构体的转换需要克服约20 kcal/mol的能垒,而酶催化的肽键旋转调控又缺乏普适性。

针对这一科学瓶颈,浙江大学(根据通讯地址推测)的研究团队在《Nature Communications》发表突破性研究,首次证明太赫兹(THz)电磁波可通过共振能量转移精确驱动σ键旋转,实现生物分子构象的可控切换。这项研究以视紫红质中的游离视黄醛(rwSb)为模型,发现4.7 THz和7.9 THz辐射可分别诱导C8-C9和C12-C13 σ键旋转,使主导构象RET-A(s-trans态)向次要构象RET-B/C(s-cis态)转化,而10.6 THz和11.1 THz则能实现逆向转换。这种"分子旋钮"效应归因于THz电场与键旋转本征频率的共振,使动能突破3-10 kcal/mol的能垒。研究进一步证实该机制可推广至水通道蛋白Aquaporin-4中精氨酸残基的构象调控,为开发非侵入性生物调控技术奠定基础。

关键技术方法包括:1) 基于GAFF力场和Amber14sb的分子动力学模拟;2) 角动量谱分析确定键旋转特征频率;3) 元动力学模拟构建二维自由能面;4) XMS-CASPT2量子化学计算验证能垒;5) 全原子系统在303.15K下的NVT系综模拟。

研究结果揭示:

THz驱动的构象转换

通过5组平行2μs模拟,发现rwSb存在四种典型构象(RET-A占比51.1±3.9%)。4.7 THz(0.8 V/nm)刺激使RET-A向RET-B转化率提升至26.9±9.6%,而10.6 THz可实现逆向调控。类似地,7.9 THz促进RET-A→RET-C转换(16.4±9.9%),11.1 THz引发逆转。

共振能量转移机制

角动量谱分析显示,RET-A在4.7 THz处存在特征峰,与C8-C9键扭转模式匹配。THz电场通过偶极耦合使旋转动能(ER)从96±19 kJ/mol增至116±25 kJ/mol,足以克服28.5 kJ/mol能垒。

生物物理效应

构象变化使opsin-rwSb结合自由能降低,主要源于邻近氨基酸相互作用改变。系统RMSD波动<0.2 nm,证明THz刺激不影响蛋白质整体结构。

普适性验证

在水通道蛋白Aquaporin-4中,THz辐射同样驱动Arg216的C-N σ键旋转,证实该技术对多种生物分子的适用性。

这项研究开创性地建立了太赫兹辐射与分子构象调控的定量关系,其意义在于:1) 提供了一种分子特异性、非侵入性的构象操控手段,克服了传统方法的局限性;2) 揭示了THz-分子旋转共振的物理化学本质,为电磁场生物效应研究提供新范式;3) 在药物设计领域,可通过远程调控配体构象来优化受体-配体相互作用;4) 为发展基于太赫兹技术的精准医疗(如神经调控、靶向治疗)奠定理论基础。正如作者Zhi Zhu、Shiyu Gu等强调的,这项发现将推动太赫兹技术在生物医学工程、超分子化学等领域的交叉应用。

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