亚马逊地区Rhinophylla pumilio蝙蝠中发现新型四细小病毒(Tetraparvovirus)全基因组测序及进化分析

【字体: 时间:2025年08月01日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.6

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  来自巴西帕拉州的研究人员通过对亚马逊地区Rhinophylla pumilio蝙蝠组织样本进行宏基因组测序,鉴定出一种新型四细小病毒(Tetraparvovirus)。该病毒NS1基因与巴西负鼠源毒株氨基酸同源性达80.96%,但低于物种划分阈值,可能代表新物种。这是继加纳果蝠后发现的首例美洲蝙蝠四细小病毒,为研究跨物种传播提供了重要线索。

  

在巴西亚马逊雨林的科研探险中,科学家们从一只健康的Rhinophylla pumilio蝙蝠(俗称"矮鼻果蝠")身上取得了突破性发现。这只雄性成体蝙蝠于2015年4月7日捕获于帕拉州的圣巴巴拉地区(坐标1.208333°S,48.270833°W),其脾脏、肺脏、心脏和淋巴结组织经过混合处理后,通过高通量测序技术揭开了一个病毒学新篇章。

研究团队采用Illumina NextSeq 500测序平台,配合PureLink RNA提取试剂盒和SuperScript IV逆转录系统,获得了4300多万条读长。经过MEGAHIT软件组装,从中拼出一条长达5258个核苷酸的单链DNA病毒基因组,GC含量54.8%。这个神秘病毒属于细小病毒科(Parvoviridae)的四细小病毒属(Tetraparvovirus),基因组结构典型:包含NS1复制酶基因(206-2194位点)和VP衣壳蛋白基因(2222-4963位点)。

最令人惊讶的是系统进化分析结果。虽然该病毒与巴西负鼠源四细小病毒(Tetraparvovirus didelphimorph1)亲缘最近,但NS1蛋白同源性仅80.96%,低于国际病毒分类委员会(ICTV)规定的85%物种划分阈值。通过IQ-TREE构建的最大似然进化树(采用Q.yeast+F+G4模型)显示,这个新病毒与已知蝙蝠源四细小病毒chiropteran1(来自加纳果蝠)分属不同进化分支,却与南美洲负鼠病毒形成独立分支。

这项发现意义非凡:不仅是美洲大陆首次在蝙蝠中发现四细小病毒,其独特的进化地位更暗示了跨物种传播的可能途径。研究人员特别指出,脾脏和淋巴结等淋巴组织可能是该病毒的重要复制场所,这为后续研究人兽共患病传播风险提供了关键靶点。该项目获得巴西高等教育人才协调委员会(CAPES)的"Pro-Amazonia"计划资助(编号3286/2013),所有实验均通过Evandro Chagas研究所动物伦理委员会审批(许可号21/2014和10/2024)。

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