新加坡沿海水域马尾藻内生芽孢杆菌目基因组挖掘及其次级代谢产物生物合成潜力

来自新加坡的研究团队从本土马尾藻(Sargassum ilicifolium)中分离出4株芽孢杆菌目(Bacillales)菌株(SSi122/130/176/177)，通过全基因组测序和生物信息学分析，发现这些海洋来源菌株携带编码抗菌肽(如paeninodin)、铁载体(如pulcherrimic acid)和生物表面活性剂(如lychenisin)等活性物质的基因簇，为开发新型海洋微生物药物提供了宝贵资源。

　　

在圣约翰岛北部采集的马尾藻样本中，研究人员通过含碲酸钾(K₂TeO_{3>)的选择性培养基分离出四株芽孢杆菌目菌株。基因组测序显示：SSi130(普里斯特氏菌Priestia megaterium)携带编码抗菌肽paeninodin和铁螯合剂pulcherrimic acid的基因簇；SSi177(高地芽孢杆菌Bacillus altitudinis)则含有产藻毒素bacilysin、群体感应因子sporulation killing factor以及生物表面活性剂lychenisin的合成通路。}

使用Illumina HiSeq X Ten平台获得150bp双端测序数据，经SPAdes组装和PGAP注释后，GTDB-Tk鉴定显示这些菌株与参考基因组平均核苷酸相似性(ANI)>95%。值得注意的是，SSi130中还发现了一个7,447bp的pBM200型质粒。antiSMASH分析揭示了这些海洋菌株具有丰富的生物活性物质合成潜能，包括具有抗菌作用的羊毛硫抗生素和可用于微生物采油的生物表面活性剂等。

该研究由新加坡科技研究局(A*STAR)和新加坡环境生命科学工程中心(SCELSE)资助，为开发海洋微生物资源提供了重要基因组学基础。