中国江西猕猴桃溃疡病病原菌Pseudomonas syringae pv. actinidiae FX219株全基因组测序及致病机制研究

来自江西省农业科学院的研究人员针对猕猴桃细菌性溃疡病这一毁灭性病害，完成了病原菌Pseudomonas syringae pv. actinidiae（Psa）FX219株的高质量全基因组测序。该菌株基因组大小为6,605,063 bp，GC含量58.34%，鉴定出4类分泌系统（T1SS-T6SS），其中III型和VI型分泌系统是关键的毒力因子，为解析猕猴桃溃疡病致病机制提供了重要理论依据。

　　

在猕猴桃种植业中，由丁香假单胞菌猕猴桃致病变种(Pseudomonas syringae pv. actinidiae, Psa)引发的细菌性溃疡病已成为最具破坏性的病害。这项研究聚焦于中国江西奉新县猕猴桃病枝中分离的FX219菌株，通过PacBio Sequel IIe和Illumina Novaseq X plus双平台测序，获得6.6 Mb的高质量环状染色体基因组，GC含量达58.34%。

有趣的是，基因组注释揭示了4类分泌系统的存在，特别是22个III型分泌系统(T3SS)基因和30个VI型分泌系统(T6SS)基因，这些被证实是Psa致病的关键武器。通过平均核苷酸一致性(ANI)分析显示，该菌株与新西兰ICMP18708株和中国云南3.2株的相似性均超过99.9%。

实验过程中，研究人员采用King's B(KB)培养基培养病原菌，使用psa特异性引物PsaF1/PsaR2进行分子鉴定。基因组测序数据经fastp v0.20.0质控，Canu v2.2组装，最终获得包含5,989个基因的完整图谱，其中还鉴定出65个tRNA、196个小RNA以及6个5S rRNA等非编码元件。

这项研究不仅提供了首个来自江西地区的Psa高质量参考基因组，更重要的是通过分泌系统等毒力因子的鉴定，为开发新型防控策略奠定了分子基础。毕竟，当这些微型分子注射器(T3SS)将效应蛋白注入宿主细胞时，正是猕猴桃溃疡病爆发的关键时刻。