保加利亚特有植物黄芪内生菌Paenibacillus spp. AASFL403全基因组测序及其植物促生机制研究

来自保加利亚的研究团队完成了特有植物Astracantha arnacantha内生菌Paenibacillus spp. AASFL403的全基因组测序（5.07 Mbp，GC含量39.48%），通过Nanopore长读长技术揭示其含4,394个CDS和25个rRNA，与P. nuruki等菌株ANI>95%，为植物-微生物互作及生物技术应用提供新资源。

　　

科研人员成功解析了从保加利亚特有植物Astracantha arnacantha（黄芪属）中分离的内生菌Paenibacillus spp. AASFL403的完整基因组图谱。这个革兰氏阳性、杆状且能运动的细菌属于Paenibacillaceae家族，基因组大小5,066,866bp，包含4,394个蛋白质编码基因、25个核糖体RNA和77个转运RNA，GC含量为39.48%。

通过牛津纳米孔技术（Oxford Nanopore）MinION Mk1C平台进行长读长测序，配合Trycycler组装和Medaka校正，最终获得完整环状基因组。有趣的是，基因组比较显示该菌株与P. nuruki TI45-13ar等三个近缘菌株的平均核苷酸相似度（ANI）超过95%。

这种植物内生菌具有多重生物技术潜力：既能固定大气氮素，又可溶解土壤中的磷酸盐和钾元素；既能产生植物生长激素吲哚-3-乙酸（IAA），又能作为生物防治剂对抗植物病原体。研究人员特别指出，宿主植物Astracantha arnacantha subsp. aitosensis是第三纪孑遗物种，其特殊的内生菌群可能参与了植物活性代谢产物的合成。

实验采用严格的表面消毒流程：70%乙醇处理1分钟→2.5%次氯酸钠消毒4分钟→二次乙醇漂洗→无菌水冲洗三次，最终在MRS培养基上获得纯培养。基因组注释通过NCBI PGAP流程完成，质量评估显示组装完整度高达99.45%。该研究为开发新型农业微生物制剂和探索植物-微生物共生机制提供了重要基因组资源。

（注：本研究获保加利亚"下一代欧盟"国家复苏计划BG-RRP-2.004-0004-C01项目资助，测序工作由保加利亚"感染与免疫基础与转化研究中心"BG16RFPR002-1.014-0017项目支持）