利用香蕉茎秆优化Bacillus safensis FB03木聚糖酶发酵培养基及基因组定位研究

【字体: 时间:2025年08月01日 来源:Electronic Journal of Biotechnology 2.5

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  为解决工业酶生产成本高的问题,研究人员利用香蕉茎秆作为新型碳源,通过Box-Behnken设计优化Bacillus safensis FB03的木聚糖酶发酵条件,获得最高酶活25.24 U/mL,纯化后活性提升10倍至143.6 U/mL,并定位了xynA、xynB等关键基因,为低成本酶生产及菌株改造提供新策略。

  

随着全球对环保型工业酶需求的激增,如何低成本生产高效木聚糖酶成为生物技术领域的核心挑战。传统发酵依赖昂贵的纯木聚糖作为碳源,而农业废弃物如香蕉茎秆(rachis)的年废弃量达数百万吨,其富含半纤维素却未被充分开发。与此同时,Bacillus safensis因其非致病性和多酶合成能力被视为潜力菌种,但相关基因组研究仍属空白。

针对这些问题,孟加拉国科学与工业研究理事会(Bangladesh Council of Scientific and Industrial Research, BCSIR)Dhaka实验室的研究团队开展了一项创新研究。他们从当地土壤分离出Bacillus safensis FB03菌株,首次以香蕉茎秆替代传统碳源,结合Box-Behnken设计(BBD)优化发酵参数,并通过全基因组注释解析木聚糖代谢基因簇。相关成果发表于《Electronic Journal of Biotechnology》,为农业废弃物高值化利用和工业菌株改造提供了双突破。

研究采用五项关键技术:1)以香蕉茎秆为碳源的Minimal Salt Media(MSM)筛选高活性菌株;2)BBD设计六因素(碳源、酵母提取物、K2HPO4、NaNO3、温度、时间)三水平优化实验;3)CM-Sephadex C-50柱层析纯化酶;4)DNS法测定酶活及Bradford法测蛋白浓度;5)Proksee和CAZy数据库注释基因组中糖代谢相关基因。

结果部分
3.1 菌株筛选与初筛活性
从64株土壤细菌中筛选出FB03,其水解圈达21 mm,在含2%香蕉茎秆的MSM中酶活达14.95 U/mL,显著高于其他菌株。

3.2 BBD优化发酵条件
54组实验显示最佳组合为2 g/L香蕉茎秆、1 g/L酵母提取物、1 g/L K2HPO4、5 g/L NaNO3、35°C和72 h,酶活提升至25.24 U/mL。模型R2值0.936证实可靠性, Pareto图揭示时间(E)和温度(F)为最显著影响因子。

3.4 酶学特性
纯化后比活达143.6 U/mL(蛋白浓度2.3 mg/mL)。该酶在60°C和pH 6-10范围内保持稳定,70°C时活性骤降至40.86 U/mL,符合多数细菌木聚糖酶特性。

3.6 动力学参数
以山毛榉木聚糖为底物时,Km值0.64 mg/mL表明高亲和力,Vmax达156.25 μmol/min/mg,催化效率优异。

3.7 基因组注释
发现xynA(1338 bp)、xynB1-B3(1500-1626 bp)、xylP(1392 bp)和xylT(1341 bp)基因簇,分别编码木聚糖水解酶和木糖转运蛋白。CAZy分析显示38.58%基因为糖苷水解酶(GH),34.51%为糖基转移酶(GT),证实其多碳水化合物代谢潜能。

结论与意义
该研究首次实现香蕉茎秆作为低成本碳源生产木聚糖酶,较传统培养基降低成本超80%。通过BBD设计将产量提升68%,且纯化酶耐热耐碱特性满足造纸、饲料等工业需求。基因组层面解析xyn基因簇位置,为CRISPR编辑提升产量提供靶点。尤其值得注意的是,FB03的GH家族基因占比显著高于同类菌株,暗示其可能成为“碳水化合物降解工具箱菌株”。这一成果不仅为农业废弃物资源化提供范例,更填补了Bacillus safensis物种基因组注释的空白,对开发新型工业酶制剂具有里程碑意义。

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