时光胶囊中的鱼类肠道菌群：基于博物馆组学技术的卡奔塔利亚湾鱼类微生物组研究

来自澳大利亚的研究人员利用冷冻保存11年的鱼类标本，首次系统评估了博物馆收藏标本在鱼类肠道菌群研究中的价值。通过对7种隆头鱼科和鲬科鱼类胃肠道样本的16S rRNA基因测序，发现冷冻标本能提供高质量的细菌DNA，其测序数据与当代研究相当，并鉴定出γ-变形菌纲等核心菌群及Epulopiscium属潜在共生菌。该研究为利用历史标本开展微生物组比较研究建立了重要基线。

　　

时间仿佛被冻结在标本中——研究人员创新性地利用博物馆组学技术，对来自澳大利亚卡奔塔利亚湾的冷冻鱼类标本展开肠道菌群研究。这些在澳大利亚国家鱼类标本馆保存11年的标本，包括隆头鱼科和鲬科共7个物种，成为研究宿主-微生物相互作用的独特时间胶囊。

通过提取胃肠道样本的DNA，采用Illumina平台对16S rRNA基因进行测序分析。令人振奋的是，这些"时光冻结"的标本不仅产出高质量的细菌DNA，其获得的序列读数和扩增子序列变异(ASVs)数量与当代研究具有可比性。研究揭示了两科鱼类的核心和独特菌群组成，其中γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)成员尤为突出，更发现了可能具有共生关系的Epulopiscium属细菌。

这项开创性工作首次证实冷冻标本在肠道菌群研究中的价值，为未来开展历史与当代标本的比较研究奠定了重要基础。这些沉睡在博物馆的"微生物时间胶囊"，正等待着被更多研究者唤醒，以揭示宿主-微生物共生关系的演化奥秘。