综述：蛋白质组学如何揭示COVID-19感染的奥秘？质谱技术作为发现新型蛋白质生物标志物的工具

这篇综述系统阐述了质谱（MS）技术在COVID-19蛋白质组学研究中的关键作用，通过分析血浆/血清蛋白质谱（proteomics）揭示疾病生物标志物（biomarkers），探讨了样本前处理（如去高丰度蛋白策略）对低丰度蛋白检测的影响，为理解SARS-CoV-2致病机制、预后预测及靶向治疗开发提供了重要技术支撑。

　　

Abstract
COVID-19大流行由SARS-CoV-2冠状病毒引发，自2019年底以来持续威胁全球公共卫生。蛋白质组学技术特别是质谱（MS）因其高灵敏度成为发现疾病相关蛋白质标志物的核心工具。血浆和血清作为易获取的生物样本，其蛋白质动态变化可反映感染进程，但高丰度蛋白（如白蛋白）的干扰需要通过去高丰度蛋白策略（depletion strategies）和分级分离（fractionating）技术来提升低丰度蛋白的检出率。

关键技术突破
轨道阱（Orbitrap）等高分辨率质谱仪实现了对COVID-19患者血清中数千种蛋白质的同步鉴定与定量。研究发现，补体系统（Complement system）蛋白C3、纤维蛋白原（Fibrinogen）链等与疾病重症化显著相关，而载脂蛋白（Apolipoproteins）家族成员则可能成为早期诊断标志物。值得注意的是，质谱数据揭示的干扰素刺激基因（ISGs）表达谱为理解宿主抗病毒免疫应答提供了分子层面的证据。

临床转化挑战
尽管发现了一批候选标志物，但血液样本的异质性和前处理标准化仍是临床转化的主要瓶颈。最新研究采用磁珠纯化（Magnetic bead purification）结合微流控芯片（Microfluidic chips）技术，将标志物检测灵敏度提升至飞摩尔（fM）级别。此外，机器学习算法（如随机森林模型）被用于整合多组学数据，显著提高了对急性呼吸窘迫综合征（ARDS）等重症并发症的预测准确性。

未来展望
单细胞质谱（scMS）技术和空间蛋白质组学（Spatial proteomics）的发展，将有望在宿主-病毒相互作用图谱绘制方面取得突破。同时，基于质谱的靶向蛋白质定量（PRM/SRM）技术正在推动个体化诊疗方案的制定，例如通过监测血管紧张素转换酶2（ACE2）的剪切形式来评估药物干预效果。这些进展为应对未来新发突发传染病提供了重要的技术储备。