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泛素化相关基因标志物(MMP1/RNF2/TFRC/SPP1/CXCL8)在宫颈癌预后预测中的鉴定与验证
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月30日 来源:Frontiers in Genetics 2.8
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本研究通过整合自测序数据与TCGA-GTEx-CESC数据集,鉴定出MMP1、RNF2、TFRC、SPP1和CXCL8五个泛素化相关基因(UBLGs)作为宫颈癌(CC)预后标志物。构建的风险评分模型(AUC>0.6)可有效预测患者生存率,免疫微环境分析揭示高风险组存在12种差异免疫细胞浸润和4个免疫检查点异常表达,为CC个体化治疗提供新靶点。
泛素化相关基因在宫颈癌预后预测中的突破性发现
1 Introduction
宫颈癌(CC)作为女性生殖系统最常见恶性肿瘤,全球每年新增病例达57.7万例。尽管中国5年生存率(67.6%)优于美国(62.6%),但约30%患者治疗后出现复发转移。泛素-泛素样(UB/UBL)修饰系统通过调控蛋白质降解、DNA损伤修复等过程参与肿瘤发生发展,但其在CC中的具体作用机制尚不明确。
2 Manuscript formatting
2.1 Data sources
研究整合了8对自测CC组织样本与TCGA-GTEx-CESC数据库(304肿瘤/13正常样本),筛选出465个泛素化相关基因(UBLGs)。GSE52903数据集(55肿瘤/17正常)用于外部验证。
2.3 Acquisition and enrichment analysis of crossover genes
差异表达分析鉴定出18个关键交叉基因,包括MMP1、RNF2等5个标志物。GO分析显示这些基因显著富集于"辐射响应"等条目,KEGG分析提示IL-17信号通路激活。
3 Results
3.2 Identification of cervical cancer-related DEGs
自测数据集发现2545个DEGs,TCGA数据集检出14538个DEGs。热图显示MMP1等基因在肿瘤组织中显著上调。
3.3 Identification of five biomarkers
LASSO-Cox回归确定MMP1、RNF2(环指蛋白2)、TFRC(转铁蛋白受体1)、SPP1(骨桥蛋白)和CXCL8(IL-8)构成预后模型。风险评分公式为:风险评分=∑(基因系数×表达量)。
3.4 Creation of nomogram
列线图分析显示风险评分是独立预后因素(C-index=0.692),1/3/5年生存预测AUC分别为0.77/0.78/0.75。校准曲线证实模型预测准确性。
3.5 The GSEA in two risk subgroups
高风险组显著富集"角质化包膜"形成和IL-17信号通路,后者通过招募髓系抑制细胞促进血管生成并抑制抗肿瘤免疫。
3.6 Immune-infiltration analysis between two risk subgroups
CIBERSORT分析发现记忆B细胞、M0型巨噬细胞等12种免疫细胞存在差异浸润。风险评分与活化肥大细胞呈最强正相关(r=0.32)。
3.7 Analyses of immune-checkpoint expression and anti-cancer immune response
反常现象:低风险组TIGIT、LAG-3、GAL9和PD-1表达更高,可能与功能性免疫微环境相关。TIP分析显示CD4+ T细胞活性差异显著。
3.8 Drug sensitivity
高风险组对Dactolisib(IC50=0.12μM)、奥沙利铂等14种药物敏感性降低,但对吉非替尼等6种药物敏感性升高。
3.9 Expression and RT-qPCR validation
qPCR验证显示MMP1(2.1倍)、TFRC(1.8倍)和CXCL8(2.3倍)在肿瘤组织中显著上调(p<0.05),而RNF2和SPP1差异不显著。
4 Discussion
MMP1通过激活PAR-1受体促进血管通透性,其表达受NF-κB泛素化调控。CXCL8通过STAT3通路协同增强MMP1的促侵袭作用。TFRC通过HIF-1/PI3K-AKT通路参与铁代谢调控。RNF2作为PRC1核心组分,可能通过表观遗传沉默抑癌基因。SPP1通过整合素信号促进ECM降解。
免疫微环境分析发现PD-1高表达与良好预后相关,挑战了传统认知。这可能反映"热肿瘤"特征——免疫检查点表达标志着预存免疫应答而非衰竭状态。
5 Conclusion
该研究建立的5基因标志物模型为CC预后预测提供新工具,同时揭示泛素化修饰与免疫微环境的交互作用机制。未来需扩大样本验证蛋白水平表达,并探索RNF2在放疗敏感性调控中的具体作用。
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