PRKCD基因错义变异与乳腺癌风险的关联研究:新型生物标志物的发现与临床意义

【字体: 时间:2025年07月30日 来源:Breast Cancer Research 6.1

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  本研究首次揭示PRKCD基因错义变异rs782555227(G/A)、rs1703449438(T/C)和rs1575535582(T/G)与乳腺癌的显著关联,通过360例患者和363例对照的基因型分析,发现这些变异与转移、BRCA1状态等临床特征相关,为早期诊断提供了潜在遗传标记。论文发表于《Breast Cancer Research》。

  

乳腺癌是全球女性健康的首要威胁,每年导致数十万人死亡,但其早期诊断仍面临生物标志物不足的挑战。蛋白激酶Cδ(PRKCD)作为调控细胞增殖和存活的关键激酶,在多种癌症中异常表达,但其遗传变异与乳腺癌的关联尚未明确。巴基斯坦国立科学技术大学(National University of Sciences and Technology, NUST)的研究团队在《Breast Cancer Research》发表论文,首次系统分析了PRKCD错义变异在乳腺癌中的作用。

研究团队采用多学科方法,从dbSNP和Ensembl数据库中筛选PRKCD的潜在致病性错义变异,通过AlphaMissense等6种算法预测其功能影响,并对巴基斯坦360例乳腺癌患者和363例健康对照进行基因分型。关键实验技术包括Tetra ARMS PCR(四引物扩增受阻突变系统)检测变异、RNAfold分析mRNA二级结构稳定性,以及统计学模型(卡方检验、逻辑回归)评估临床关联性。

研究结果

PRKCD变异筛选与功能预测
通过计算工具筛选出4个错义变异(rs1703806197、rs782555227、rs1703449438、rs1575535582),预测其导致PKCδ蛋白稳定性下降(ΔΔG值变化)和mRNA结构扰动(自由能变化)。例如,rs1575535582(V114G)使C2样结构域突变,可能影响钙离子结合功能。

基因型与乳腺癌关联

  • rs782555227(G/A):AG基因型显著增加乳腺癌风险(OR=2.018, p=0.0062),A等位基因与转移(OR=4.54)和绝经状态相关。
  • rs1703449438(T/C):TT基因型高风险(OR=2.2),而CC基因型具有保护作用(OR=0.7),TC基因型与HER2+亚型强相关(OR=3.976)。
  • rs1575535582(T/G):TG基因型增加风险(OR=1.7),TT基因型与BRCA1阳性(OR=2.2)和转移相关。

临床特征关联

  • 转移:rs782555227-AG和rs1703449438-TC基因型显著促进转移(p<0.0001)。
  • 分子亚型:rs1703449438-CC在HER2+乳腺癌中富集(p<0.0001)。
  • 分期:rs1575535582-TT与II期癌症强相关(OR=3.620)。

结论与意义

该研究首次证实PRKCD错义变异通过破坏PKCδ功能参与乳腺癌发生,尤其驱动转移和特定亚型进展。rs782555227和rs1575535582可作为潜在诊断标记,而rs1703449438或为HER2+乳腺癌的靶向干预点。局限性包括需扩大队列验证和功能实验(如磷酸化活性检测)。未来研究应探索这些变异如何调控ERK/Src等致癌通路,为精准医疗提供新策略。

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