IL-37b变体的计算设计:阻断二聚化并增强单体稳定性的抗炎治疗新策略

【字体: 时间:2025年07月29日 来源:International Journal of Biological Macromolecules 7.7

编辑推荐:

  本研究针对IL-37b二聚化倾向强且单体稳定性差的问题,通过计算蛋白质工程策略设计新型变体。研究人员采用双丙氨酸扫描、位点饱和突变和分子动力学模拟等技术,鉴定出36个阻断二聚化的突变和10个增强单体稳定性的突变,为开发高效抗炎疗法提供新思路。

  

炎症性疾病治疗领域长期面临关键挑战:如何调控细胞因子的活性形式以增强疗效。作为IL-1超家族中的特殊成员,IL-37b因其独特的抗炎特性备受关注。这种由218个氨基酸组成的细胞因子具有典型的β-三叶草(β-trefoil)折叠结构,能通过结合IL-18Rα和SIGIRR受体抑制促炎信号通路。然而其天然形成的头对头二聚体结构严重限制了生物活性,而现有单体变体如Y85A又存在稳定性差、半衰期短等缺陷。

针对这一难题,中国国家自然科学基金资助项目组在《International Journal of Biological Macromolecules》发表创新研究。研究团队整合多种计算生物学技术:首先基于PDB 5HN1结构进行双丙氨酸扫描鉴定二聚化热点残基;随后采用位点饱和突变预测影响单体稳定性的突变;结合MM-PBSA和FoldX能量计算评估突变效应;最终通过分子动力学(MD)模拟验证变体构象稳定性。

【结构基础】部分揭示IL-37b二聚界面由β3-β4环和β2-β3-β11片层构成。双丙氨酸扫描发现E89、I86等关键残基对结合自由能贡献最大,其中E89L突变使结合能降低4.2 kcal/mol。

【突变设计】环节系统评估了二聚界面36个突变,包括V71R/Y85C/I86W组合使二聚体解离常数(Kd)提升100倍。在非界面区域鉴定出S114R等10个增强单体稳定性的突变,ΔΔG最高达-2.8 kcal/mol。

【分子机制】分析表明,二聚化阻断突变主要通过破坏盐桥和疏水核心实现,如E89L消除与K83的盐桥;而稳定突变如S114R通过形成新的氢键网络加固β-三叶草结构。MD模拟显示最优变体RMSF值降低35%,证实构象刚性增强。

该研究创新性提出"双功能变体"设计理念,将阻断二聚化与增强稳定性的突变组合,如V71R/Y85C/I86W/E89L/S114R五突变体。这种计算驱动的方法不仅为开发新一代抗炎药物奠定基础,更为蛋白质理性设计提供了普适性框架。作者特别指出,未来需通过体外实验验证变体的受体结合活性与免疫原性,但当前工作已突破传统试错法局限,展示了计算生物学在生物大分子工程中的强大潜力。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号