基于时滞增强SIR模型和进化算法的墨西哥COVID-19多波次疫情动态解析

【字体: 时间:2025年07月29日 来源:Journal of Theoretical Biology 1.9

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  为解决传统SIR模型瞬时转换假设与COVID-19实际传播中存在的时滞效应不匹配问题,研究人员采用时滞SIR模型结合粒子群优化(PSO)和遗传算法(GA),对墨西哥六波疫情数据进行参数和延迟时间联合估计。结果表明,时滞参数显著提升模型拟合精度,PSO与GA在含噪声数据中均表现出强鲁棒性,为复杂疫情动态建模提供了优化方法学范式。

  

2019年末出现的SARS-CoV-2病毒引发的COVID-19大流行,在全球范围内呈现出多波次、差异化的传播特征。墨西哥作为美洲地区疫情高发国家,其复杂的传播动态对传统流行病学模型提出挑战——经典SIR模型假设人群在易感(S)、感染(I)、康复(R)状态间瞬时转换,忽略了病毒潜伏期和个体恢复时间的生物学延迟效应。这种理想化假设导致模型难以准确捕捉实际疫情数据中的峰值滞后、多波次震荡等关键特征。为此,墨西哥国立自治大学工程学院(Facultad de Ingeniería, UNAM)与墨西哥城自治大学(Universidad Autónoma de la Ciudad de México)的研究团队在《Journal of Theoretical Biology》发表研究,创新性地将孵化延迟和恢复延迟引入SIR框架,并采用智能优化算法解决延迟微分方程参数估计的数学难题。

研究采用粒子群优化(PSO)和遗传算法(GA)两种进化计算方法,对墨西哥官方公布的六波COVID-19疫情数据进行模型校准。关键技术包括:1) 构建含时滞项的SIR延迟微分方程(DDE)模型;2) 设计适应度函数量化模型输出与真实病例数据的均方误差;3) 通过PSO的群体智能搜索和GA的遗传操作实现高维参数空间全局优化;4) 引入噪声测试验证算法鲁棒性。

SIR模型与延迟机制
通过引入两个关键时滞参数:τ1表示暴露到发病的孵化期延迟,τ2反映感染到康复/死亡的延迟时间,使模型能更真实地反映病毒传播动力学。理论分析显示,时滞项会显著改变基本再生数R0的计算方式,进而影响传播率β的估计精度。

优化算法性能比较
在MATLAB 2024a平台上进行的数值实验表明,PSO和GA均能稳定收敛到最优参数集。特别在第三波(Delta变异株主导)和第五波(Omicron高峰)疫情中,时滞模型的拟合优度R2达到0.92以上,较传统SIR提升约30%。噪声测试显示,即使数据包含15%随机误差,两种算法仍能保持85%以上的参数识别准确率。

多波次疫情动态解析
模型成功再现了墨西哥六波疫情的差异化特征:第一波(原始毒株)表现为单峰曲线,R0估计值为2.3±0.2;而第四波(Gamma变异株)呈现双峰结构,对应τ1延长至5.1天,反映该变异株潜伏期延长的生物学特性。最具挑战性的Omicron波次(第五波)由于超高传播率(β=0.48 day-1),模型通过缩短τ2至7天准确捕捉到其"陡升快降"的传播特征。

该研究证实时滞机制是提升流行病学模型精度的关键要素:孵化延迟主要影响疫情上升斜率,而恢复延迟决定下降沿形态。方法学上,PSO在计算效率上优于GA(平均快1.8倍),但GA对初始参数敏感性更低。这项研究不仅为墨西哥疫情防控提供数据支持,其开发的时滞模型优化框架可推广至其他传染病研究,特别是针对变异株特性快速评估的应用场景。未来工作可进一步整合年龄分层、免疫异质性等现实因素,推动流行病学建模向更高维度发展。

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