单细胞图像组学CRISPR筛选揭示埃博拉病毒(EBOV)感染动态的关键宿主调控因子

【字体: 时间:2025年07月25日 来源:Nature Microbiology 20.5

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  研究人员通过单细胞分辨率图像组学CRISPR筛选结合深度学习与随机森林模型,系统性鉴定出调控埃博拉病毒(EBOV)生命周期各阶段的998个宿主因子。研究发现线粒体复合体III亚基UQCRB调控病毒RNA复制,其小分子抑制剂可有效抑制感染;剪接体相关因子STRAP通过结合病毒蛋白VP35调控RNA-蛋白质平衡。该研究为filovirus属病毒(包括苏丹、马尔堡病毒)治疗靶点开发提供了重要资源。

  

当致死率极高的埃博拉病毒(EBOV)等丝状病毒(filoviruses)频繁引发疫情时,科学家们正苦于治疗手段的匮乏。传统遗传筛选方法难以完整捕捉病毒生命周期,而这项研究另辟蹊径:在39,085,093个单细胞中开展图像组学CRISPR筛选,犹如为病毒与宿主细胞的"攻防战"安装了超高清监控。

深度学习模型精准定位了998个宿主调控因子各自的主战场——有的影响病毒入侵,有的调控RNA复制。其中线粒体复合体III亚基UQCRB的表现尤为亮眼,作为病毒RNA复制的"后勤部长",当其被小分子抑制剂阻断时,病毒军团立刻出现补给困难。

更有趣的是随机森林模型发现的"平衡大师"STRAP,这个剪接体相关因子通过与病毒RNA加工蛋白VP35"密会",微妙调控着病毒RNA与蛋白质的黄金比例。研究团队还通过12项次级筛选验证了这些靶点在苏丹病毒、马尔堡病毒中的普适性,为抗病毒药物研发绘制了一幅详尽的"作战地图"。

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