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综述:CRISPR技术在定向进化领域的前沿研究与探索
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月29日 来源:Biotechnology Advances 12.1
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这篇综述系统阐述了CRISPR-Cas系统在定向进化(Directed Evolution)中的革命性应用,通过RNA引导核酸酶(如Cas9/Cas12a)实现精准基因编辑,结合NHEJ/HDR修复机制构建突变文库,显著提升了酶工程、代谢工程等领域的高通量筛选效率(如MALDI-ToF MS、微流控技术)。文章强调CRISPR技术兼具靶向编辑和随机诱变优势,为加速生物大分子(如抗体、酶)功能优化提供了全新范式。
Overview of CRISPR technology
CRISPR-Cas系统源自原核生物免疫机制,由CRISPR序列、Cas蛋白(如Cas9/Cas12a)和向导RNA(gRNA)构成。其核心原理是通过gRNA的20个碱基配对实现基因组靶向定位,Cas蛋白的核酸酶结构域诱导DNA断裂。相较于传统定向进化技术(如易错PCR),CRISPR系统显著提高了突变文库构建的精准度和效率。
Principles and classification of CRISPR-mediated genetic diversity
CRISPR介导的遗传多样性生成策略分为双链断裂(DSB)依赖和非依赖两类。DSB依赖策略通过调控宿主细胞的NHEJ或HDR通路产生随机突变,其中NHEJ易引入插入/缺失突变,而HDR可实现定点替换。DSB非依赖策略则利用dCas9(失活Cas9)与突变酶(如胞嘧啶脱氨酶)融合,在特定基因组区域引入单碱基编辑。
Applications of CRISPR directed evolution
在酶工程领域,CRISPR定向进化已成功应用于提高工业酶(如纤维素酶)的热稳定性和催化效率。代谢工程中,通过多重基因组编辑构建了高产β-胡萝卜素酵母菌株。抗体优化方面,CRISPR结合哺乳动物细胞展示技术加速了抗体亲和力成熟。植物育种中,该系统实现了抗病相关基因的多位点协同进化。
Conclusions and prospects
尽管CRISPR定向进化在脱靶效应和复杂表型筛选方面仍存挑战,但其与机器学习、自动化平台的整合(如OrthoRep连续进化系统)展现出巨大潜力。未来发展方向包括开发低脱靶Cas变体(如HiFi-Cas9)和建立跨物种通用编辑体系,以推动合成生物学和精准医学的突破性进展。
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