枯草芽孢杆菌SS17基因组草图解析：一种具有潜力的对虾益生菌候选株

来自孟加拉国的研究人员针对对虾养殖中病害防控的生态需求，从健康斑节对虾(Penaeus monodon)肠道分离出枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)SS17，通过全基因组测序获得4,042,212bp染色体草图，鉴定出4,215个编码基因及多种抗菌肽合成基因簇，为开发安全高效的水产益生菌提供重要分子基础。

　　

科研团队从孟加拉国Satkhira地区虾场采集的健康斑节对虾肠道中，分离出一株能高效水解淀粉、酪蛋白和胆盐的菌株SS17。通过Illumina MiSeq平台进行全基因组测序(覆盖度281×)，采用SPAdes软件进行多k-mer值(21/33/55/77)组装，获得4.04Mb基因组草图，GC含量43.7%，包含57个contig(N₅₀=490,687bp)。

基因组注释揭示该菌株含有4,251个基因，包括82个tRNA和33个rRNA。通过OrthoANIu分析证实其与枯草芽孢杆菌相似度达98%。特别值得注意的是，antiSMASH预测到表面活性素(surfactin)、杆菌溶素(bacilysin)等抗菌肽合成基因，BAGEL4还检测到subtilosin(SboX)和孢子杀伤因子(skfA)等抗菌物质。CRISPRCasFinder鉴定出2个CRISPR序列，但未发现质粒或耐药基因。

在田间试验中，SS17与另一株芽孢杆菌SS45联用显著提升对虾产量。该菌株基因组特征表明其兼具益生特性与生物安全性，为替代抗生素的水产养殖方案提供新选择。研究获孟加拉国渔业部"可持续海岸渔业项目"资助(世界银行信贷号6326-BD)。