极端环境下的生命密码：Lassen火山国家公园Saccharolobus solfataricus S441菌株全基因组解析

来自波特兰州立大学的研究团队完成了极端嗜热古菌Saccharolobus solfataricus S441菌株的全基因组测序（CP160827.2）。该菌株分离自美国Lassen火山国家公园83.6°C、pH 2的酸性热泉，基因组全长2,766,550 bp（GC含量35.7%），包含3,031个基因。研究通过纳米孔测序技术（ONT R10.4.1）和Flye组装获得完整环状基因组，其与近缘菌株P1的ANI值达98.63%，为研究古菌极端环境适应机制及病毒-宿主互作（如梭状病毒fuselloviruses）提供了重要资源。

　　

在魔鬼厨房（Devil’s Kitchen）沸腾的酸性热泉中，隐藏着一种堪称"生命炼金师"的极端嗜热古菌——Saccharolobus solfataricus S441。这个来自美国Lassen火山国家公园（坐标40.4333°N 121.6936°W）的微生物勇士，能在83.6°C高温和pH 2的强酸环境中悠然自得。研究人员采用牛津纳米孔技术（Oxford Nanopore Technologies），通过R10.4.1流动槽和Dorado碱基识别系统，成功破译了其2,766,550碱基对的完整基因组密码。

这个环状基因组藏着3,031个基因宝藏，包括2,979个蛋白编码序列（CDSs）、3类核糖体RNA（5S/16S/23S rRNA）和47个转运RNA（tRNA）。特别引人注目的是5个CRISPR防御阵列，暗示着它与噬菌体（如梭状病毒fuselloviruses）持续上演的"军备竞赛"。通过FastANI分析发现，它与近亲菌株P1的基因组相似度高达98.63%，堪称古菌界的"双胞胎兄弟"。

从采样到测序充满科技趣味：研究人员先用碳酸钙中和热泉样本（pH 2→5），在80°C的硫磺矿培养基（Sulfolobus medium）中驯养5天，最终在1%结冷胶（Gelrite）平板上获得纯培养。DNA提取过程犹如"分子烹饪"——用含十二烷基肌氨酸钠（sarcosine）和Triton X-100的裂解液处理细胞，再经过酚-氯仿"鸡尾酒"萃取和乙醇沉淀，最终获得高质量DNA。

这项发表于GenBank（登录号CP160827.2）的研究不仅丰富了极端微生物基因库，更为探索生命在高温强酸环境下的生存策略（如DNA修复、膜稳定性维持）提供了黄金标准。毕竟，能在地球"恶魔厨房"里活得滋润的生物，或许掌握着生命起源与外星生命探测的关键线索。